Protein–RNA interactions for Protein: O15269

SPTLC1, Serine palmitoyltransferase 1, humanhuman

Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTLC1O15269 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SPTLC1O15269 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SPTLC1O15269 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SPTLC1O15269 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SPTLC1O15269 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SPTLC1O15269 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SPTLC1O15269 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
SPTLC1O15269 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SPTLC1O15269 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SPTLC1O15269 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SPTLC1O15269 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SPTLC1O15269 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SPTLC1O15269 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SPTLC1O15269 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SPTLC1O15269 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SPTLC1O15269 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SPTLC1O15269 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SPTLC1O15269 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SPTLC1O15269 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SPTLC1O15269 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SPTLC1O15269 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SPTLC1O15269 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SPTLC1O15269 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SPTLC1O15269 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SPTLC1O15269 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SPTLC1O15269 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SPTLC1O15269 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SPTLC1O15269 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SPTLC1O15269 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SPTLC1O15269 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SPTLC1O15269 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SPTLC1O15269 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SPTLC1O15269 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
SPTLC1O15269 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SPTLC1O15269 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SPTLC1O15269 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SPTLC1O15269 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SPTLC1O15269 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SPTLC1O15269 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SPTLC1O15269 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SPTLC1O15269 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SPTLC1O15269 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SPTLC1O15269 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
SPTLC1O15269 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SPTLC1O15269 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SPTLC1O15269 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SPTLC1O15269 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
SPTLC1O15269 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
SPTLC1O15269 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SPTLC1O15269 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SPTLC1O15269 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SPTLC1O15269 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
SPTLC1O15269 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
SPTLC1O15269 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
SPTLC1O15269 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SPTLC1O15269 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SPTLC1O15269 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SPTLC1O15269 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SPTLC1O15269 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SPTLC1O15269 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SPTLC1O15269 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
SPTLC1O15269 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SPTLC1O15269 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SPTLC1O15269 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SPTLC1O15269 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SPTLC1O15269 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SPTLC1O15269 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SPTLC1O15269 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SPTLC1O15269 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SPTLC1O15269 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SPTLC1O15269 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SPTLC1O15269 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SPTLC1O15269 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SPTLC1O15269 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
SPTLC1O15269 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SPTLC1O15269 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SPTLC1O15269 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
SPTLC1O15269 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
SPTLC1O15269 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SPTLC1O15269 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SPTLC1O15269 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SPTLC1O15269 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SPTLC1O15269 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
SPTLC1O15269 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SPTLC1O15269 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SPTLC1O15269 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
SPTLC1O15269 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SPTLC1O15269 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SPTLC1O15269 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SPTLC1O15269 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SPTLC1O15269 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SPTLC1O15269 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SPTLC1O15269 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SPTLC1O15269 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SPTLC1O15269 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SPTLC1O15269 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SPTLC1O15269 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SPTLC1O15269 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SPTLC1O15269 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SPTLC1O15269 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms