Protein–RNA interactions for Protein: O14828

SCAMP3, Secretory carrier-associated membrane protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 347 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAMP3O14828 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SCAMP3O14828 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SCAMP3O14828 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SCAMP3O14828 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SCAMP3O14828 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SCAMP3O14828 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SCAMP3O14828 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SCAMP3O14828 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SCAMP3O14828 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SCAMP3O14828 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SCAMP3O14828 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SCAMP3O14828 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SCAMP3O14828 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SCAMP3O14828 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SCAMP3O14828 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SCAMP3O14828 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SCAMP3O14828 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SCAMP3O14828 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SCAMP3O14828 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SCAMP3O14828 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SCAMP3O14828 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SCAMP3O14828 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SCAMP3O14828 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
SCAMP3O14828 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SCAMP3O14828 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
SCAMP3O14828 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SCAMP3O14828 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SCAMP3O14828 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SCAMP3O14828 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SCAMP3O14828 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SCAMP3O14828 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SCAMP3O14828 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SCAMP3O14828 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SCAMP3O14828 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SCAMP3O14828 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SCAMP3O14828 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SCAMP3O14828 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SCAMP3O14828 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SCAMP3O14828 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
SCAMP3O14828 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SCAMP3O14828 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SCAMP3O14828 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SCAMP3O14828 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SCAMP3O14828 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SCAMP3O14828 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SCAMP3O14828 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SCAMP3O14828 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SCAMP3O14828 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SCAMP3O14828 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SCAMP3O14828 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SCAMP3O14828 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SCAMP3O14828 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SCAMP3O14828 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SCAMP3O14828 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SCAMP3O14828 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SCAMP3O14828 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SCAMP3O14828 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SCAMP3O14828 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SCAMP3O14828 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
SCAMP3O14828 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SCAMP3O14828 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SCAMP3O14828 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SCAMP3O14828 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SCAMP3O14828 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SCAMP3O14828 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SCAMP3O14828 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SCAMP3O14828 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SCAMP3O14828 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SCAMP3O14828 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SCAMP3O14828 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SCAMP3O14828 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SCAMP3O14828 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SCAMP3O14828 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SCAMP3O14828 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SCAMP3O14828 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SCAMP3O14828 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SCAMP3O14828 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SCAMP3O14828 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SCAMP3O14828 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SCAMP3O14828 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SCAMP3O14828 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SCAMP3O14828 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
SCAMP3O14828 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SCAMP3O14828 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SCAMP3O14828 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SCAMP3O14828 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SCAMP3O14828 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SCAMP3O14828 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
SCAMP3O14828 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SCAMP3O14828 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SCAMP3O14828 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SCAMP3O14828 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SCAMP3O14828 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SCAMP3O14828 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SCAMP3O14828 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
SCAMP3O14828 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SCAMP3O14828 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SCAMP3O14828 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
SCAMP3O14828 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SCAMP3O14828 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.4 ms