Protein–RNA interactions for Protein: O00192

ARVCF, Armadillo repeat protein deleted in velo-cardio-facial syndrome, humanhuman

Predictions only

Length 962 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARVCFO00192 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ARVCFO00192 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ARVCFO00192 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ARVCFO00192 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ARVCFO00192 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ARVCFO00192 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ARVCFO00192 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ARVCFO00192 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ARVCFO00192 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ARVCFO00192 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ARVCFO00192 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ARVCFO00192 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
ARVCFO00192 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ARVCFO00192 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ARVCFO00192 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
ARVCFO00192 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
ARVCFO00192 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
ARVCFO00192 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ARVCFO00192 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
ARVCFO00192 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ARVCFO00192 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ARVCFO00192 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
ARVCFO00192 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ARVCFO00192 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ARVCFO00192 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ARVCFO00192 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ARVCFO00192 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ARVCFO00192 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ARVCFO00192 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ARVCFO00192 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ARVCFO00192 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ARVCFO00192 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ARVCFO00192 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ARVCFO00192 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ARVCFO00192 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ARVCFO00192 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ARVCFO00192 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ARVCFO00192 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ARVCFO00192 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ARVCFO00192 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ARVCFO00192 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
ARVCFO00192 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ARVCFO00192 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ARVCFO00192 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ARVCFO00192 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ARVCFO00192 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
ARVCFO00192 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ARVCFO00192 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ARVCFO00192 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ARVCFO00192 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ARVCFO00192 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ARVCFO00192 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ARVCFO00192 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ARVCFO00192 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ARVCFO00192 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ARVCFO00192 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ARVCFO00192 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ARVCFO00192 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ARVCFO00192 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ARVCFO00192 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ARVCFO00192 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ARVCFO00192 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ARVCFO00192 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ARVCFO00192 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ARVCFO00192 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ARVCFO00192 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ARVCFO00192 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
ARVCFO00192 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ARVCFO00192 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ARVCFO00192 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ARVCFO00192 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ARVCFO00192 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ARVCFO00192 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ARVCFO00192 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ARVCFO00192 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
ARVCFO00192 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ARVCFO00192 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ARVCFO00192 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ARVCFO00192 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ARVCFO00192 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ARVCFO00192 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ARVCFO00192 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ARVCFO00192 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ARVCFO00192 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ARVCFO00192 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ARVCFO00192 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ARVCFO00192 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ARVCFO00192 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ARVCFO00192 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ARVCFO00192 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ARVCFO00192 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ARVCFO00192 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ARVCFO00192 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ARVCFO00192 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ARVCFO00192 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
ARVCFO00192 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ARVCFO00192 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
ARVCFO00192 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ARVCFO00192 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ARVCFO00192 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms