Protein–RNA interactions for Protein: C9JE40

PATL2, Protein PAT1 homolog 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 543 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PATL2C9JE40 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
PATL2C9JE40 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
PATL2C9JE40 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
PATL2C9JE40 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
PATL2C9JE40 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
PATL2C9JE40 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
PATL2C9JE40 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
PATL2C9JE40 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
PATL2C9JE40 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
PATL2C9JE40 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC26.17■■□□□ 1.78
PATL2C9JE40 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
PATL2C9JE40 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC26.17■■□□□ 1.78
PATL2C9JE40 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
PATL2C9JE40 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
PATL2C9JE40 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
PATL2C9JE40 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
PATL2C9JE40 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
PATL2C9JE40 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
PATL2C9JE40 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
PATL2C9JE40 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
PATL2C9JE40 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
PATL2C9JE40 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
PATL2C9JE40 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
PATL2C9JE40 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
PATL2C9JE40 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
PATL2C9JE40 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
PATL2C9JE40 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
PATL2C9JE40 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
PATL2C9JE40 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
PATL2C9JE40 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
PATL2C9JE40 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
PATL2C9JE40 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.15■■□□□ 1.78
PATL2C9JE40 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
PATL2C9JE40 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
PATL2C9JE40 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
PATL2C9JE40 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
PATL2C9JE40 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
PATL2C9JE40 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
PATL2C9JE40 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
PATL2C9JE40 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
PATL2C9JE40 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
PATL2C9JE40 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
PATL2C9JE40 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
PATL2C9JE40 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
PATL2C9JE40 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
PATL2C9JE40 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
PATL2C9JE40 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.77
PATL2C9JE40 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
PATL2C9JE40 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
PATL2C9JE40 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
PATL2C9JE40 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
PATL2C9JE40 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
PATL2C9JE40 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
PATL2C9JE40 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
PATL2C9JE40 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
PATL2C9JE40 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
PATL2C9JE40 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
PATL2C9JE40 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
PATL2C9JE40 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
PATL2C9JE40 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PATL2C9JE40 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
PATL2C9JE40 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PATL2C9JE40 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
PATL2C9JE40 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PATL2C9JE40 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PATL2C9JE40 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC26.12■■□□□ 1.77
PATL2C9JE40 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
PATL2C9JE40 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PATL2C9JE40 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
PATL2C9JE40 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PATL2C9JE40 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PATL2C9JE40 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PATL2C9JE40 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PATL2C9JE40 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
PATL2C9JE40 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PATL2C9JE40 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PATL2C9JE40 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PATL2C9JE40 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
PATL2C9JE40 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
PATL2C9JE40 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PATL2C9JE40 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PATL2C9JE40 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PATL2C9JE40 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PATL2C9JE40 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PATL2C9JE40 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PATL2C9JE40 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
PATL2C9JE40 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
PATL2C9JE40 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PATL2C9JE40 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC26.1■■□□□ 1.77
PATL2C9JE40 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
PATL2C9JE40 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
PATL2C9JE40 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
PATL2C9JE40 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PATL2C9JE40 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
PATL2C9JE40 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
PATL2C9JE40 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
PATL2C9JE40 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
PATL2C9JE40 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PATL2C9JE40 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PATL2C9JE40 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.9 ms