Protein–RNA interactions for Protein: A8MQ27

NEURL1B, E3 ubiquitin-protein ligase NEURL1B, humanhuman

Predictions only

Length 555 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEURL1BA8MQ27 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
NEURL1BA8MQ27 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
NEURL1BA8MQ27 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC27.57■■■□□ 2
NEURL1BA8MQ27 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
NEURL1BA8MQ27 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
NEURL1BA8MQ27 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC27.57■■■□□ 2
NEURL1BA8MQ27 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
NEURL1BA8MQ27 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
NEURL1BA8MQ27 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
NEURL1BA8MQ27 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
NEURL1BA8MQ27 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
NEURL1BA8MQ27 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
NEURL1BA8MQ27 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
NEURL1BA8MQ27 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC27.56■■■□□ 2
NEURL1BA8MQ27 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
NEURL1BA8MQ27 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC27.56■■■□□ 2
NEURL1BA8MQ27 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
NEURL1BA8MQ27 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
NEURL1BA8MQ27 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
NEURL1BA8MQ27 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
NEURL1BA8MQ27 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
NEURL1BA8MQ27 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
NEURL1BA8MQ27 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
NEURL1BA8MQ27 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
NEURL1BA8MQ27 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC27.55■■■□□ 2
NEURL1BA8MQ27 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC27.55■■■□□ 2
NEURL1BA8MQ27 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
NEURL1BA8MQ27 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
NEURL1BA8MQ27 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC27.55■■■□□ 2
NEURL1BA8MQ27 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
NEURL1BA8MQ27 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
NEURL1BA8MQ27 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
NEURL1BA8MQ27 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
NEURL1BA8MQ27 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
NEURL1BA8MQ27 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
NEURL1BA8MQ27 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
NEURL1BA8MQ27 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
NEURL1BA8MQ27 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
NEURL1BA8MQ27 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
NEURL1BA8MQ27 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC27.54■■■□□ 2
NEURL1BA8MQ27 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
NEURL1BA8MQ27 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
NEURL1BA8MQ27 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC27.53■■■□□ 2
NEURL1BA8MQ27 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
NEURL1BA8MQ27 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC27.53■■■□□ 2
NEURL1BA8MQ27 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
NEURL1BA8MQ27 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
NEURL1BA8MQ27 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
NEURL1BA8MQ27 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC27.52■■■□□ 2
NEURL1BA8MQ27 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
NEURL1BA8MQ27 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
NEURL1BA8MQ27 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
NEURL1BA8MQ27 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC27.52■■■□□ 2
NEURL1BA8MQ27 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
NEURL1BA8MQ27 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
NEURL1BA8MQ27 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
NEURL1BA8MQ27 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
NEURL1BA8MQ27 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
NEURL1BA8MQ27 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
NEURL1BA8MQ27 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
NEURL1BA8MQ27 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
NEURL1BA8MQ27 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
NEURL1BA8MQ27 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
NEURL1BA8MQ27 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
NEURL1BA8MQ27 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
NEURL1BA8MQ27 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
NEURL1BA8MQ27 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
NEURL1BA8MQ27 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
NEURL1BA8MQ27 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
NEURL1BA8MQ27 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
NEURL1BA8MQ27 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
NEURL1BA8MQ27 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
NEURL1BA8MQ27 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
NEURL1BA8MQ27 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
NEURL1BA8MQ27 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
NEURL1BA8MQ27 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
NEURL1BA8MQ27 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC27.49■■□□□ 1.99
NEURL1BA8MQ27 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
NEURL1BA8MQ27 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
NEURL1BA8MQ27 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
NEURL1BA8MQ27 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
NEURL1BA8MQ27 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
NEURL1BA8MQ27 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
NEURL1BA8MQ27 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
NEURL1BA8MQ27 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
NEURL1BA8MQ27 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
NEURL1BA8MQ27 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
NEURL1BA8MQ27 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
NEURL1BA8MQ27 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
NEURL1BA8MQ27 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
NEURL1BA8MQ27 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
NEURL1BA8MQ27 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
NEURL1BA8MQ27 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
NEURL1BA8MQ27 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
NEURL1BA8MQ27 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
NEURL1BA8MQ27 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
NEURL1BA8MQ27 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
NEURL1BA8MQ27 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
NEURL1BA8MQ27 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC27.48■■□□□ 1.99
NEURL1BA8MQ27 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.6 ms