Protein–RNA interactions for Protein: A6NNY8

USP27X, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 27, humanhuman

Predictions only

Length 438 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP27XA6NNY8 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
USP27XA6NNY8 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
USP27XA6NNY8 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
USP27XA6NNY8 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
USP27XA6NNY8 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
USP27XA6NNY8 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
USP27XA6NNY8 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
USP27XA6NNY8 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
USP27XA6NNY8 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
USP27XA6NNY8 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
USP27XA6NNY8 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
USP27XA6NNY8 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
USP27XA6NNY8 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
USP27XA6NNY8 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
USP27XA6NNY8 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
USP27XA6NNY8 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
USP27XA6NNY8 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
USP27XA6NNY8 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
USP27XA6NNY8 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
USP27XA6NNY8 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
USP27XA6NNY8 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
USP27XA6NNY8 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
USP27XA6NNY8 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
USP27XA6NNY8 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
USP27XA6NNY8 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
USP27XA6NNY8 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
USP27XA6NNY8 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
USP27XA6NNY8 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
USP27XA6NNY8 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
USP27XA6NNY8 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
USP27XA6NNY8 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
USP27XA6NNY8 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
USP27XA6NNY8 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
USP27XA6NNY8 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
USP27XA6NNY8 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
USP27XA6NNY8 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
USP27XA6NNY8 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
USP27XA6NNY8 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
USP27XA6NNY8 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
USP27XA6NNY8 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
USP27XA6NNY8 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
USP27XA6NNY8 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
USP27XA6NNY8 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
USP27XA6NNY8 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
USP27XA6NNY8 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
USP27XA6NNY8 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
USP27XA6NNY8 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
USP27XA6NNY8 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
USP27XA6NNY8 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
USP27XA6NNY8 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
USP27XA6NNY8 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
USP27XA6NNY8 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
USP27XA6NNY8 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
USP27XA6NNY8 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
USP27XA6NNY8 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
USP27XA6NNY8 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
USP27XA6NNY8 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
USP27XA6NNY8 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
USP27XA6NNY8 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
USP27XA6NNY8 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
USP27XA6NNY8 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
USP27XA6NNY8 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
USP27XA6NNY8 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
USP27XA6NNY8 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
USP27XA6NNY8 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
USP27XA6NNY8 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
USP27XA6NNY8 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
USP27XA6NNY8 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
USP27XA6NNY8 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
USP27XA6NNY8 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
USP27XA6NNY8 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
USP27XA6NNY8 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
USP27XA6NNY8 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
USP27XA6NNY8 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
USP27XA6NNY8 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
USP27XA6NNY8 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
USP27XA6NNY8 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
USP27XA6NNY8 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
USP27XA6NNY8 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
USP27XA6NNY8 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
USP27XA6NNY8 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
USP27XA6NNY8 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
USP27XA6NNY8 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
USP27XA6NNY8 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
USP27XA6NNY8 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
USP27XA6NNY8 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
USP27XA6NNY8 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
USP27XA6NNY8 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
USP27XA6NNY8 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
USP27XA6NNY8 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
USP27XA6NNY8 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
USP27XA6NNY8 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
USP27XA6NNY8 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
USP27XA6NNY8 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
USP27XA6NNY8 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
USP27XA6NNY8 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
USP27XA6NNY8 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
USP27XA6NNY8 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
USP27XA6NNY8 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
USP27XA6NNY8 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms