Protein–RNA interactions for Protein: A6NNM8

TTLL13P, Tubulin polyglutamylase TTLL13P, humanhuman

Predictions only

Length 815 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTLL13PA6NNM8 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TTLL13PA6NNM8 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TTLL13PA6NNM8 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TTLL13PA6NNM8 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TTLL13PA6NNM8 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TTLL13PA6NNM8 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TTLL13PA6NNM8 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
TTLL13PA6NNM8 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TTLL13PA6NNM8 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
TTLL13PA6NNM8 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TTLL13PA6NNM8 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TTLL13PA6NNM8 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
TTLL13PA6NNM8 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TTLL13PA6NNM8 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TTLL13PA6NNM8 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TTLL13PA6NNM8 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TTLL13PA6NNM8 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TTLL13PA6NNM8 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
TTLL13PA6NNM8 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
TTLL13PA6NNM8 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TTLL13PA6NNM8 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
TTLL13PA6NNM8 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
TTLL13PA6NNM8 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TTLL13PA6NNM8 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TTLL13PA6NNM8 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TTLL13PA6NNM8 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TTLL13PA6NNM8 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TTLL13PA6NNM8 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
TTLL13PA6NNM8 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TTLL13PA6NNM8 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TTLL13PA6NNM8 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TTLL13PA6NNM8 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TTLL13PA6NNM8 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TTLL13PA6NNM8 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
TTLL13PA6NNM8 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TTLL13PA6NNM8 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
TTLL13PA6NNM8 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.43
TTLL13PA6NNM8 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.43
TTLL13PA6NNM8 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
TTLL13PA6NNM8 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TTLL13PA6NNM8 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
TTLL13PA6NNM8 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TTLL13PA6NNM8 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
TTLL13PA6NNM8 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
TTLL13PA6NNM8 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TTLL13PA6NNM8 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
TTLL13PA6NNM8 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TTLL13PA6NNM8 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TTLL13PA6NNM8 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TTLL13PA6NNM8 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TTLL13PA6NNM8 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TTLL13PA6NNM8 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TTLL13PA6NNM8 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TTLL13PA6NNM8 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TTLL13PA6NNM8 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TTLL13PA6NNM8 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TTLL13PA6NNM8 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TTLL13PA6NNM8 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TTLL13PA6NNM8 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TTLL13PA6NNM8 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TTLL13PA6NNM8 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TTLL13PA6NNM8 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TTLL13PA6NNM8 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TTLL13PA6NNM8 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TTLL13PA6NNM8 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TTLL13PA6NNM8 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TTLL13PA6NNM8 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TTLL13PA6NNM8 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TTLL13PA6NNM8 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TTLL13PA6NNM8 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TTLL13PA6NNM8 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TTLL13PA6NNM8 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TTLL13PA6NNM8 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TTLL13PA6NNM8 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TTLL13PA6NNM8 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TTLL13PA6NNM8 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TTLL13PA6NNM8 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TTLL13PA6NNM8 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TTLL13PA6NNM8 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TTLL13PA6NNM8 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TTLL13PA6NNM8 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
TTLL13PA6NNM8 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TTLL13PA6NNM8 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TTLL13PA6NNM8 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TTLL13PA6NNM8 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TTLL13PA6NNM8 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TTLL13PA6NNM8 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
TTLL13PA6NNM8 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC23.92■■□□□ 1.42
TTLL13PA6NNM8 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
TTLL13PA6NNM8 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
TTLL13PA6NNM8 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
TTLL13PA6NNM8 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TTLL13PA6NNM8 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TTLL13PA6NNM8 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TTLL13PA6NNM8 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TTLL13PA6NNM8 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TTLL13PA6NNM8 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
TTLL13PA6NNM8 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TTLL13PA6NNM8 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TTLL13PA6NNM8 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms