Protein–RNA interactions for Protein: A6NLC5

C3orf70, UPF0524 protein C3orf70, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C3orf70A6NLC5 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
C3orf70A6NLC5 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
C3orf70A6NLC5 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
C3orf70A6NLC5 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
C3orf70A6NLC5 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
C3orf70A6NLC5 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
C3orf70A6NLC5 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
C3orf70A6NLC5 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
C3orf70A6NLC5 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
C3orf70A6NLC5 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
C3orf70A6NLC5 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
C3orf70A6NLC5 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
C3orf70A6NLC5 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
C3orf70A6NLC5 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
C3orf70A6NLC5 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
C3orf70A6NLC5 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
C3orf70A6NLC5 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
C3orf70A6NLC5 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
C3orf70A6NLC5 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
C3orf70A6NLC5 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
C3orf70A6NLC5 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
C3orf70A6NLC5 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
C3orf70A6NLC5 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
C3orf70A6NLC5 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
C3orf70A6NLC5 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
C3orf70A6NLC5 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
C3orf70A6NLC5 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
C3orf70A6NLC5 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
C3orf70A6NLC5 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
C3orf70A6NLC5 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
C3orf70A6NLC5 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC22.76■■□□□ 1.23
C3orf70A6NLC5 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
C3orf70A6NLC5 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
C3orf70A6NLC5 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
C3orf70A6NLC5 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
C3orf70A6NLC5 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
C3orf70A6NLC5 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
C3orf70A6NLC5 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
C3orf70A6NLC5 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
C3orf70A6NLC5 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
C3orf70A6NLC5 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
C3orf70A6NLC5 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
C3orf70A6NLC5 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
C3orf70A6NLC5 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
C3orf70A6NLC5 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
C3orf70A6NLC5 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
C3orf70A6NLC5 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
C3orf70A6NLC5 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
C3orf70A6NLC5 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
C3orf70A6NLC5 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
C3orf70A6NLC5 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
C3orf70A6NLC5 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
C3orf70A6NLC5 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
C3orf70A6NLC5 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
C3orf70A6NLC5 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
C3orf70A6NLC5 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
C3orf70A6NLC5 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
C3orf70A6NLC5 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
C3orf70A6NLC5 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
C3orf70A6NLC5 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
C3orf70A6NLC5 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
C3orf70A6NLC5 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
C3orf70A6NLC5 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
C3orf70A6NLC5 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
C3orf70A6NLC5 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
C3orf70A6NLC5 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
C3orf70A6NLC5 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
C3orf70A6NLC5 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
C3orf70A6NLC5 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
C3orf70A6NLC5 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
C3orf70A6NLC5 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
C3orf70A6NLC5 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
C3orf70A6NLC5 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
C3orf70A6NLC5 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
C3orf70A6NLC5 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
C3orf70A6NLC5 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
C3orf70A6NLC5 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
C3orf70A6NLC5 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
C3orf70A6NLC5 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
C3orf70A6NLC5 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
C3orf70A6NLC5 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
C3orf70A6NLC5 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
C3orf70A6NLC5 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
C3orf70A6NLC5 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
C3orf70A6NLC5 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
C3orf70A6NLC5 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
C3orf70A6NLC5 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
C3orf70A6NLC5 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
C3orf70A6NLC5 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
C3orf70A6NLC5 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
C3orf70A6NLC5 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
C3orf70A6NLC5 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
C3orf70A6NLC5 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
C3orf70A6NLC5 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
C3orf70A6NLC5 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
C3orf70A6NLC5 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
C3orf70A6NLC5 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
C3orf70A6NLC5 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
C3orf70A6NLC5 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
C3orf70A6NLC5 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms