Protein–RNA interactions for Protein: A6NIK2

LRRC10B, Leucine-rich repeat-containing protein 10B, humanhuman

Predictions only

Length 292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC10BA6NIK2 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
LRRC10BA6NIK2 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
LRRC10BA6NIK2 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
LRRC10BA6NIK2 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
LRRC10BA6NIK2 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
LRRC10BA6NIK2 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
LRRC10BA6NIK2 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
LRRC10BA6NIK2 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
LRRC10BA6NIK2 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
LRRC10BA6NIK2 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
LRRC10BA6NIK2 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
LRRC10BA6NIK2 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
LRRC10BA6NIK2 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
LRRC10BA6NIK2 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
LRRC10BA6NIK2 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
LRRC10BA6NIK2 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
LRRC10BA6NIK2 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
LRRC10BA6NIK2 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
LRRC10BA6NIK2 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
LRRC10BA6NIK2 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
LRRC10BA6NIK2 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC23.93■■□□□ 1.42
LRRC10BA6NIK2 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
LRRC10BA6NIK2 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
LRRC10BA6NIK2 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
LRRC10BA6NIK2 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
LRRC10BA6NIK2 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
LRRC10BA6NIK2 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
LRRC10BA6NIK2 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
LRRC10BA6NIK2 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
LRRC10BA6NIK2 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
LRRC10BA6NIK2 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
LRRC10BA6NIK2 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
LRRC10BA6NIK2 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
LRRC10BA6NIK2 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
LRRC10BA6NIK2 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
LRRC10BA6NIK2 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
LRRC10BA6NIK2 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
LRRC10BA6NIK2 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
LRRC10BA6NIK2 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
LRRC10BA6NIK2 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
LRRC10BA6NIK2 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
LRRC10BA6NIK2 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
LRRC10BA6NIK2 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
LRRC10BA6NIK2 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
LRRC10BA6NIK2 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
LRRC10BA6NIK2 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
LRRC10BA6NIK2 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
LRRC10BA6NIK2 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
LRRC10BA6NIK2 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
LRRC10BA6NIK2 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
LRRC10BA6NIK2 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
LRRC10BA6NIK2 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
LRRC10BA6NIK2 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
LRRC10BA6NIK2 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
LRRC10BA6NIK2 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
LRRC10BA6NIK2 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
LRRC10BA6NIK2 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
LRRC10BA6NIK2 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
LRRC10BA6NIK2 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
LRRC10BA6NIK2 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
LRRC10BA6NIK2 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
LRRC10BA6NIK2 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
LRRC10BA6NIK2 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
LRRC10BA6NIK2 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
LRRC10BA6NIK2 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.41
LRRC10BA6NIK2 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
LRRC10BA6NIK2 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
LRRC10BA6NIK2 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
LRRC10BA6NIK2 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
LRRC10BA6NIK2 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
LRRC10BA6NIK2 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
LRRC10BA6NIK2 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
LRRC10BA6NIK2 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
LRRC10BA6NIK2 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
LRRC10BA6NIK2 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
LRRC10BA6NIK2 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
LRRC10BA6NIK2 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
LRRC10BA6NIK2 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
LRRC10BA6NIK2 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
LRRC10BA6NIK2 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
LRRC10BA6NIK2 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
LRRC10BA6NIK2 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
LRRC10BA6NIK2 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
LRRC10BA6NIK2 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
LRRC10BA6NIK2 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
LRRC10BA6NIK2 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
LRRC10BA6NIK2 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
LRRC10BA6NIK2 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
LRRC10BA6NIK2 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
LRRC10BA6NIK2 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
LRRC10BA6NIK2 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
LRRC10BA6NIK2 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
LRRC10BA6NIK2 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
LRRC10BA6NIK2 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
LRRC10BA6NIK2 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
LRRC10BA6NIK2 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
LRRC10BA6NIK2 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
LRRC10BA6NIK2 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
LRRC10BA6NIK2 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
LRRC10BA6NIK2 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.9 ms