Protein–RNA interactions for Protein: A6NCI4

VWA3A, von Willebrand factor A domain-containing protein 3A, humanhuman

Predictions only

Length 1,184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VWA3AA6NCI4 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
VWA3AA6NCI4 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
VWA3AA6NCI4 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
VWA3AA6NCI4 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
VWA3AA6NCI4 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
VWA3AA6NCI4 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
VWA3AA6NCI4 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
VWA3AA6NCI4 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
VWA3AA6NCI4 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
VWA3AA6NCI4 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
VWA3AA6NCI4 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
VWA3AA6NCI4 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
VWA3AA6NCI4 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
VWA3AA6NCI4 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
VWA3AA6NCI4 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
VWA3AA6NCI4 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
VWA3AA6NCI4 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
VWA3AA6NCI4 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
VWA3AA6NCI4 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
VWA3AA6NCI4 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
VWA3AA6NCI4 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
VWA3AA6NCI4 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
VWA3AA6NCI4 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
VWA3AA6NCI4 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
VWA3AA6NCI4 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
VWA3AA6NCI4 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
VWA3AA6NCI4 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
VWA3AA6NCI4 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
VWA3AA6NCI4 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
VWA3AA6NCI4 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
VWA3AA6NCI4 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
VWA3AA6NCI4 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
VWA3AA6NCI4 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
VWA3AA6NCI4 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
VWA3AA6NCI4 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
VWA3AA6NCI4 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
VWA3AA6NCI4 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
VWA3AA6NCI4 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
VWA3AA6NCI4 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
VWA3AA6NCI4 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
VWA3AA6NCI4 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
VWA3AA6NCI4 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
VWA3AA6NCI4 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
VWA3AA6NCI4 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
VWA3AA6NCI4 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
VWA3AA6NCI4 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
VWA3AA6NCI4 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
VWA3AA6NCI4 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
VWA3AA6NCI4 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
VWA3AA6NCI4 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
VWA3AA6NCI4 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
VWA3AA6NCI4 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
VWA3AA6NCI4 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
VWA3AA6NCI4 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
VWA3AA6NCI4 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
VWA3AA6NCI4 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
VWA3AA6NCI4 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
VWA3AA6NCI4 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
VWA3AA6NCI4 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
VWA3AA6NCI4 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
VWA3AA6NCI4 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
VWA3AA6NCI4 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
VWA3AA6NCI4 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
VWA3AA6NCI4 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
VWA3AA6NCI4 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
VWA3AA6NCI4 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
VWA3AA6NCI4 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
VWA3AA6NCI4 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
VWA3AA6NCI4 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
VWA3AA6NCI4 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.56
VWA3AA6NCI4 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
VWA3AA6NCI4 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
VWA3AA6NCI4 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
VWA3AA6NCI4 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.56
VWA3AA6NCI4 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
VWA3AA6NCI4 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
VWA3AA6NCI4 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
VWA3AA6NCI4 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
VWA3AA6NCI4 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
VWA3AA6NCI4 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
VWA3AA6NCI4 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
VWA3AA6NCI4 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
VWA3AA6NCI4 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
VWA3AA6NCI4 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
VWA3AA6NCI4 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
VWA3AA6NCI4 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
VWA3AA6NCI4 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
VWA3AA6NCI4 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
VWA3AA6NCI4 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
VWA3AA6NCI4 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
VWA3AA6NCI4 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
VWA3AA6NCI4 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
VWA3AA6NCI4 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
VWA3AA6NCI4 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
VWA3AA6NCI4 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
VWA3AA6NCI4 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
VWA3AA6NCI4 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
VWA3AA6NCI4 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
VWA3AA6NCI4 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
VWA3AA6NCI4 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.3 ms