Protein–RNA interactions for Protein: A2RU54

HMX2, Homeobox protein HMX2, humanhuman

Predictions only

Length 273 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMX2A2RU54 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
HMX2A2RU54 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
HMX2A2RU54 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
HMX2A2RU54 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
HMX2A2RU54 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
HMX2A2RU54 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
HMX2A2RU54 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
HMX2A2RU54 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
HMX2A2RU54 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
HMX2A2RU54 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
HMX2A2RU54 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
HMX2A2RU54 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
HMX2A2RU54 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
HMX2A2RU54 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
HMX2A2RU54 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
HMX2A2RU54 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
HMX2A2RU54 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
HMX2A2RU54 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
HMX2A2RU54 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
HMX2A2RU54 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
HMX2A2RU54 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
HMX2A2RU54 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
HMX2A2RU54 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
HMX2A2RU54 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
HMX2A2RU54 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
HMX2A2RU54 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
HMX2A2RU54 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
HMX2A2RU54 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
HMX2A2RU54 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
HMX2A2RU54 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
HMX2A2RU54 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
HMX2A2RU54 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
HMX2A2RU54 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
HMX2A2RU54 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
HMX2A2RU54 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
HMX2A2RU54 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
HMX2A2RU54 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
HMX2A2RU54 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
HMX2A2RU54 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
HMX2A2RU54 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
HMX2A2RU54 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
HMX2A2RU54 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
HMX2A2RU54 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
HMX2A2RU54 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
HMX2A2RU54 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
HMX2A2RU54 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
HMX2A2RU54 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
HMX2A2RU54 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
HMX2A2RU54 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
HMX2A2RU54 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
HMX2A2RU54 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
HMX2A2RU54 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
HMX2A2RU54 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
HMX2A2RU54 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
HMX2A2RU54 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
HMX2A2RU54 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
HMX2A2RU54 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
HMX2A2RU54 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
HMX2A2RU54 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
HMX2A2RU54 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
HMX2A2RU54 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
HMX2A2RU54 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
HMX2A2RU54 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
HMX2A2RU54 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
HMX2A2RU54 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
HMX2A2RU54 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
HMX2A2RU54 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
HMX2A2RU54 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
HMX2A2RU54 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
HMX2A2RU54 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
HMX2A2RU54 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
HMX2A2RU54 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
HMX2A2RU54 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
HMX2A2RU54 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
HMX2A2RU54 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
HMX2A2RU54 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
HMX2A2RU54 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
HMX2A2RU54 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
HMX2A2RU54 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
HMX2A2RU54 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
HMX2A2RU54 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
HMX2A2RU54 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
HMX2A2RU54 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC21.77■■□□□ 1.08
HMX2A2RU54 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
HMX2A2RU54 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
HMX2A2RU54 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
HMX2A2RU54 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
HMX2A2RU54 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
HMX2A2RU54 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
HMX2A2RU54 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
HMX2A2RU54 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
HMX2A2RU54 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
HMX2A2RU54 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
HMX2A2RU54 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
HMX2A2RU54 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
HMX2A2RU54 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
HMX2A2RU54 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
HMX2A2RU54 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
HMX2A2RU54 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
HMX2A2RU54 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms