Protein–RNA interactions for Protein: A2A3L6

TTC24, Tetratricopeptide repeat protein 24, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 582 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC24A2A3L6 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
TTC24A2A3L6 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
TTC24A2A3L6 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TTC24A2A3L6 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TTC24A2A3L6 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TTC24A2A3L6 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TTC24A2A3L6 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TTC24A2A3L6 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
TTC24A2A3L6 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
TTC24A2A3L6 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
TTC24A2A3L6 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TTC24A2A3L6 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TTC24A2A3L6 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TTC24A2A3L6 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TTC24A2A3L6 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
TTC24A2A3L6 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
TTC24A2A3L6 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TTC24A2A3L6 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TTC24A2A3L6 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TTC24A2A3L6 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TTC24A2A3L6 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TTC24A2A3L6 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TTC24A2A3L6 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TTC24A2A3L6 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TTC24A2A3L6 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TTC24A2A3L6 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TTC24A2A3L6 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TTC24A2A3L6 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TTC24A2A3L6 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TTC24A2A3L6 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
TTC24A2A3L6 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TTC24A2A3L6 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TTC24A2A3L6 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TTC24A2A3L6 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TTC24A2A3L6 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TTC24A2A3L6 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TTC24A2A3L6 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TTC24A2A3L6 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TTC24A2A3L6 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TTC24A2A3L6 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TTC24A2A3L6 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TTC24A2A3L6 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TTC24A2A3L6 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
TTC24A2A3L6 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
TTC24A2A3L6 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TTC24A2A3L6 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TTC24A2A3L6 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TTC24A2A3L6 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TTC24A2A3L6 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
TTC24A2A3L6 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
TTC24A2A3L6 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TTC24A2A3L6 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TTC24A2A3L6 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TTC24A2A3L6 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TTC24A2A3L6 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TTC24A2A3L6 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TTC24A2A3L6 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TTC24A2A3L6 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TTC24A2A3L6 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TTC24A2A3L6 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TTC24A2A3L6 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
TTC24A2A3L6 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TTC24A2A3L6 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TTC24A2A3L6 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TTC24A2A3L6 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TTC24A2A3L6 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TTC24A2A3L6 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TTC24A2A3L6 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TTC24A2A3L6 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TTC24A2A3L6 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TTC24A2A3L6 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TTC24A2A3L6 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TTC24A2A3L6 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TTC24A2A3L6 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TTC24A2A3L6 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TTC24A2A3L6 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TTC24A2A3L6 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TTC24A2A3L6 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
TTC24A2A3L6 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TTC24A2A3L6 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TTC24A2A3L6 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TTC24A2A3L6 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TTC24A2A3L6 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TTC24A2A3L6 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
TTC24A2A3L6 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TTC24A2A3L6 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
TTC24A2A3L6 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TTC24A2A3L6 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TTC24A2A3L6 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TTC24A2A3L6 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TTC24A2A3L6 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TTC24A2A3L6 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TTC24A2A3L6 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TTC24A2A3L6 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TTC24A2A3L6 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
TTC24A2A3L6 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TTC24A2A3L6 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TTC24A2A3L6 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TTC24A2A3L6 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TTC24A2A3L6 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.8 ms