Protein–RNA interactions for Protein: A0A539

TCRBV7S3A2, T-cell receptor beta variable 4-2 (Fragment), humanhuman

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Length 114 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCRBV7S3A2A0A539 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TCRBV7S3A2A0A539 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TCRBV7S3A2A0A539 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TCRBV7S3A2A0A539 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TCRBV7S3A2A0A539 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TCRBV7S3A2A0A539 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TCRBV7S3A2A0A539 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TCRBV7S3A2A0A539 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TCRBV7S3A2A0A539 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TCRBV7S3A2A0A539 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TCRBV7S3A2A0A539 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TCRBV7S3A2A0A539 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TCRBV7S3A2A0A539 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TCRBV7S3A2A0A539 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TCRBV7S3A2A0A539 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TCRBV7S3A2A0A539 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TCRBV7S3A2A0A539 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TCRBV7S3A2A0A539 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TCRBV7S3A2A0A539 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TCRBV7S3A2A0A539 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TCRBV7S3A2A0A539 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TCRBV7S3A2A0A539 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TCRBV7S3A2A0A539 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TCRBV7S3A2A0A539 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TCRBV7S3A2A0A539 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TCRBV7S3A2A0A539 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TCRBV7S3A2A0A539 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
TCRBV7S3A2A0A539 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
TCRBV7S3A2A0A539 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
TCRBV7S3A2A0A539 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
TCRBV7S3A2A0A539 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TCRBV7S3A2A0A539 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TCRBV7S3A2A0A539 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TCRBV7S3A2A0A539 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TCRBV7S3A2A0A539 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TCRBV7S3A2A0A539 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TCRBV7S3A2A0A539 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TCRBV7S3A2A0A539 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TCRBV7S3A2A0A539 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TCRBV7S3A2A0A539 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TCRBV7S3A2A0A539 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TCRBV7S3A2A0A539 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TCRBV7S3A2A0A539 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TCRBV7S3A2A0A539 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TCRBV7S3A2A0A539 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TCRBV7S3A2A0A539 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TCRBV7S3A2A0A539 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TCRBV7S3A2A0A539 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TCRBV7S3A2A0A539 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TCRBV7S3A2A0A539 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
TCRBV7S3A2A0A539 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TCRBV7S3A2A0A539 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TCRBV7S3A2A0A539 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TCRBV7S3A2A0A539 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TCRBV7S3A2A0A539 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TCRBV7S3A2A0A539 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TCRBV7S3A2A0A539 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
TCRBV7S3A2A0A539 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TCRBV7S3A2A0A539 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TCRBV7S3A2A0A539 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TCRBV7S3A2A0A539 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TCRBV7S3A2A0A539 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
TCRBV7S3A2A0A539 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
TCRBV7S3A2A0A539 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TCRBV7S3A2A0A539 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TCRBV7S3A2A0A539 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TCRBV7S3A2A0A539 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.15
TCRBV7S3A2A0A539 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.15
TCRBV7S3A2A0A539 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
TCRBV7S3A2A0A539 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TCRBV7S3A2A0A539 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TCRBV7S3A2A0A539 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TCRBV7S3A2A0A539 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TCRBV7S3A2A0A539 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TCRBV7S3A2A0A539 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TCRBV7S3A2A0A539 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TCRBV7S3A2A0A539 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TCRBV7S3A2A0A539 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TCRBV7S3A2A0A539 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TCRBV7S3A2A0A539 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TCRBV7S3A2A0A539 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TCRBV7S3A2A0A539 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TCRBV7S3A2A0A539 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TCRBV7S3A2A0A539 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TCRBV7S3A2A0A539 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TCRBV7S3A2A0A539 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TCRBV7S3A2A0A539 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TCRBV7S3A2A0A539 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TCRBV7S3A2A0A539 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TCRBV7S3A2A0A539 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TCRBV7S3A2A0A539 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TCRBV7S3A2A0A539 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TCRBV7S3A2A0A539 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TCRBV7S3A2A0A539 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TCRBV7S3A2A0A539 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TCRBV7S3A2A0A539 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TCRBV7S3A2A0A539 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TCRBV7S3A2A0A539 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TCRBV7S3A2A0A539 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TCRBV7S3A2A0A539 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
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