Protein–RNA interactions for Protein: A0A0U1RQF3

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,178 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A0A0U1RQF3 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
A0A0U1RQF3 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
A0A0U1RQF3 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
A0A0U1RQF3 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
A0A0U1RQF3 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
A0A0U1RQF3 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
A0A0U1RQF3 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
A0A0U1RQF3 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
A0A0U1RQF3 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
A0A0U1RQF3 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
A0A0U1RQF3 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
A0A0U1RQF3 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
A0A0U1RQF3 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
A0A0U1RQF3 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
A0A0U1RQF3 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
A0A0U1RQF3 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
A0A0U1RQF3 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
A0A0U1RQF3 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
A0A0U1RQF3 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
A0A0U1RQF3 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC23.76■■□□□ 1.39
A0A0U1RQF3 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
A0A0U1RQF3 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
A0A0U1RQF3 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
A0A0U1RQF3 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
A0A0U1RQF3 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
A0A0U1RQF3 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
A0A0U1RQF3 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
A0A0U1RQF3 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
A0A0U1RQF3 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
A0A0U1RQF3 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
A0A0U1RQF3 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
A0A0U1RQF3 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
A0A0U1RQF3 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
A0A0U1RQF3 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC23.75■■□□□ 1.39
A0A0U1RQF3 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
A0A0U1RQF3 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
A0A0U1RQF3 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
A0A0U1RQF3 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
A0A0U1RQF3 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
A0A0U1RQF3 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
A0A0U1RQF3 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
A0A0U1RQF3 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
A0A0U1RQF3 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
A0A0U1RQF3 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
A0A0U1RQF3 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
A0A0U1RQF3 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
A0A0U1RQF3 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
A0A0U1RQF3 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
A0A0U1RQF3 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
A0A0U1RQF3 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
A0A0U1RQF3 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
A0A0U1RQF3 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
A0A0U1RQF3 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
A0A0U1RQF3 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
A0A0U1RQF3 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
A0A0U1RQF3 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
A0A0U1RQF3 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
A0A0U1RQF3 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
A0A0U1RQF3 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
A0A0U1RQF3 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
A0A0U1RQF3 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
A0A0U1RQF3 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
A0A0U1RQF3 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
A0A0U1RQF3 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
A0A0U1RQF3 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
A0A0U1RQF3 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
A0A0U1RQF3 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
A0A0U1RQF3 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
A0A0U1RQF3 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
A0A0U1RQF3 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
A0A0U1RQF3 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
A0A0U1RQF3 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
A0A0U1RQF3 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
A0A0U1RQF3 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
A0A0U1RQF3 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
A0A0U1RQF3 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
A0A0U1RQF3 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
A0A0U1RQF3 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
A0A0U1RQF3 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
A0A0U1RQF3 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
A0A0U1RQF3 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
A0A0U1RQF3 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
A0A0U1RQF3 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
A0A0U1RQF3 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
A0A0U1RQF3 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC23.7■■□□□ 1.38
A0A0U1RQF3 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
A0A0U1RQF3 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC23.7■■□□□ 1.38
A0A0U1RQF3 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
A0A0U1RQF3 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
A0A0U1RQF3 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
A0A0U1RQF3 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
A0A0U1RQF3 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
A0A0U1RQF3 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
A0A0U1RQF3 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
A0A0U1RQF3 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
A0A0U1RQF3 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
A0A0U1RQF3 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
A0A0U1RQF3 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
A0A0U1RQF3 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
A0A0U1RQF3 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms