Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3F1

Putative TAP2-associated 6.5 kDa polypeptide, humanhuman

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Length 56 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9Y3F1 AC105105.4-201ENST00000610389 713 ntBASIC14□□□□□ -0.17
Q9Y3F1 ATXN10-212ENST00000640901 1185 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Q9Y3F1 MEX3B-202ENST00000558133 4333 ntBASIC14□□□□□ -0.17
Q9Y3F1 PIGG-202ENST00000383028 2787 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Q9Y3F1 NR1H3-221ENST00000481889 1704 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Q9Y3F1 LINC00664-201ENST00000596203 1742 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Q9Y3F1 TRIM39-204ENST00000396548 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Q9Y3F1 TSFM-204ENST00000454289 2192 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Q9Y3F1 EFHC1-224ENST00000636702 2197 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Q9Y3F1 AC010327.5-201ENST00000586923 3061 ntBASIC14□□□□□ -0.17
Q9Y3F1 KATNAL2-202ENST00000356157 1635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Q9Y3F1 NIF3L1-201ENST00000359683 1626 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Q9Y3F1 GDAP1L1-206ENST00000537864 2855 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
Q9Y3F1 GMCL1-201ENST00000282570 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Q9Y3F1 AMOTL2-212ENST00000514516 4521 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
Q9Y3F1 IQCB1-202ENST00000349820 1919 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Q9Y3F1 SPATA31C1-202ENST00000602681 1927 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
Q9Y3F1 GHET1-201ENST00000627071 1906 ntBASIC14□□□□□ -0.17
Q9Y3F1 TAF6-205ENST00000437822 2318 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Q9Y3F1 SLC2A14-213ENST00000539924 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Q9Y3F1 ROBO4-201ENST00000306534 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Q9Y3F1 DZANK1-201ENST00000262547 3498 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Q9Y3F1 TGM3-201ENST00000381458 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Q9Y3F1 SMARCA2-203ENST00000349721 5761 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Q9Y3F1 LRRFIP1-204ENST00000392000 3365 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Q9Y3F1 SPOCK3-210ENST00000506886 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Q9Y3F1 UBR5-207ENST00000520539 10297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Q9Y3F1 AGAP12P-202ENST00000603888 2141 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Q9Y3F1 AC095350.1-201ENST00000443685 1711 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Q9Y3F1 SLC26A6-213ENST00000455886 2460 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Q9Y3F1 AP001062.1-201ENST00000448927 4354 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Q9Y3F1 TLR8-AS1-201ENST00000451564 1349 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Q9Y3F1 TMLHE-201ENST00000334398 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Q9Y3F1 ZNF124-201ENST00000340684 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Q9Y3F1 IKZF1-206ENST00000359197 3487 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Q9Y3F1 ABCD3-201ENST00000315713 884 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Q9Y3F1 GMNN-202ENST00000356509 1133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Q9Y3F1 LINC00685-201ENST00000391707 428 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Q9Y3F1 GAPDHP65-201ENST00000425487 1006 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Q9Y3F1 LINC01508-201ENST00000425666 1013 ntTSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Q9Y3F1 AC096919.1-201ENST00000472730 652 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Q9Y3F1 AC091057.1-201ENST00000501830 970 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Q9Y3F1 AP005901.1-201ENST00000508721 1181 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Q9Y3F1 BCAR1P1-201ENST00000553953 636 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Q9Y3F1 NR2F2-AS1-210ENST00000561344 966 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Q9Y3F1 AL353708.1-201ENST00000567904 1257 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Q9Y3F1 AC091588.2-201ENST00000578741 366 ntTSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Q9Y3F1 FAM95B1-214ENST00000593216 759 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Q9Y3F1 AL078590.3-201ENST00000607531 750 ntTSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Q9Y3F1 AL133551.1-201ENST00000610279 1222 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Q9Y3F1 FDPS-220ENST00000611010 1196 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Q9Y3F1 AC080038.2-201ENST00000617734 423 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Q9Y3F1 Metazoa_SRP.97-201ENST00000618280 304 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Q9Y3F1 C12orf45-205ENST00000622317 1078 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Q9Y3F1 ARL14EPL-203ENST00000634632 642 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Q9Y3F1 ZBTB2-201ENST00000325144 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Q9Y3F1 PPP6R2-203ENST00000395741 3304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Q9Y3F1 FAM86JP-201ENST00000467239 1910 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Q9Y3F1 AP000347.1-201ENST00000417194 5004 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Q9Y3F1 POLN-210ENST00000511885 3253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Q9Y3F1 KCNV1-201ENST00000297404 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Q9Y3F1 MAP7D2-201ENST00000379643 3918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Q9Y3F1 AGAP2-203ENST00000547588 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Q9Y3F1 GGA1-206ENST00000406772 3205 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Q9Y3F1 FOXN3-219ENST00000615335 2421 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Q9Y3F1 TMEM123-201ENST00000361236 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Q9Y3F1 CES1P1-201ENST00000421606 1704 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Q9Y3F1 AL606760.3-201ENST00000569869 3591 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Q9Y3F1 MTRF1L-202ENST00000367231 3539 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Q9Y3F1 PRKAB1-205ENST00000540121 1673 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Q9Y3F1 KDM8-212ENST00000568965 1655 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Q9Y3F1 NOTCH4-201ENST00000375023 6745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Q9Y3F1 ANGPTL2-202ENST00000373425 3707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Q9Y3F1 PMS1-204ENST00000409823 2795 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Q9Y3F1 EBLN3P-202ENST00000625445 4520 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Q9Y3F1 ZNF155-207ENST00000590615 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Q9Y3F1 AGRN-201ENST00000379370 7323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Q9Y3F1 REG3A-201ENST00000305165 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Q9Y3F1 FOLR1-201ENST00000312293 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Q9Y3F1 LRRN1-201ENST00000319331 3823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Q9Y3F1 KRTAP12-4-201ENST00000391618 447 ntAPPRIS P1 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Q9Y3F1 AC005587.1-201ENST00000401879 592 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Q9Y3F1 FAM25E-201ENST00000411791 322 ntTSL 3 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Q9Y3F1 AC003101.1-201ENST00000412403 459 ntTSL 3 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Q9Y3F1 ATXN8OS-201ENST00000414504 1148 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Q9Y3F1 AL354714.2-201ENST00000425270 1097 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Q9Y3F1 AL132709.1-202ENST00000448840 588 ntTSL 3 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Q9Y3F1 AC246817.2-204ENST00000517984 562 ntTSL 4 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Q9Y3F1 ABCC6P2-201ENST00000526069 590 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Q9Y3F1 SDHD-204ENST00000528021 1071 ntTSL 3 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Q9Y3F1 SDHD-205ENST00000528048 905 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Q9Y3F1 AP001922.6-201ENST00000532553 546 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Q9Y3F1 LMO3-228ENST00000541846 573 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Q9Y3F1 AP000812.3-201ENST00000544535 609 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Q9Y3F1 AC121320.1-201ENST00000580975 839 ntTSL 3 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Q9Y3F1 AC025682.1-203ENST00000584391 442 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Q9Y3F1 TCF4-AS1-201ENST00000587660 396 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Q9Y3F1 TMED1-204ENST00000588289 541 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Q9Y3F1 AC090236.1-201ENST00000590318 768 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Q9Y3F1 RPL37A-212ENST00000600880 425 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
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