Protein–RNA interactions for Protein: Q8TAP4

LMO3, LIM domain only protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 145 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO3Q8TAP4 IP6K3-202ENST00000451316 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
LMO3Q8TAP4 AFAP1-204ENST00000420658 7768 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
LMO3Q8TAP4 DPYSL2-204ENST00000521913 4805 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
LMO3Q8TAP4 IFT88-202ENST00000351808 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
LMO3Q8TAP4 SEPT9-203ENST00000427177 3821 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
LMO3Q8TAP4 SPECC1L-ADORA2A-201ENST00000358654 6204 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
LMO3Q8TAP4 BCKDHA-202ENST00000457836 1745 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
LMO3Q8TAP4 C14orf159-203ENST00000412671 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
LMO3Q8TAP4 KCTD10-201ENST00000228495 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
LMO3Q8TAP4 KRTAP10-4-201ENST00000400374 1643 ntAPPRIS P2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
LMO3Q8TAP4 PAX6-217ENST00000481563 1587 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
LMO3Q8TAP4 GPR176-201ENST00000299092 3844 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
LMO3Q8TAP4 MRPL48-201ENST00000310614 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
LMO3Q8TAP4 AC023830.3-201ENST00000612995 1455 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
LMO3Q8TAP4 KCNC2-201ENST00000298972 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
LMO3Q8TAP4 ALLC-201ENST00000252505 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
LMO3Q8TAP4 TUT1-202ENST00000308436 2826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
LMO3Q8TAP4 AL357054.4-201ENST00000606285 2814 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
LMO3Q8TAP4 GAPDH-205ENST00000396861 1348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
LMO3Q8TAP4 TRPV1-204ENST00000425167 2607 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
LMO3Q8TAP4 CU639417.6-202ENST00000624872 3241 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
LMO3Q8TAP4 CMTM5-204ENST00000382809 378 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
LMO3Q8TAP4 INMT-202ENST00000409539 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
LMO3Q8TAP4 AL451105.2-201ENST00000413763 1234 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
LMO3Q8TAP4 AL929302.1-201ENST00000426556 871 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
LMO3Q8TAP4 KRTAP9-10P-201ENST00000435672 207 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
LMO3Q8TAP4 MIR503HG-202ENST00000440570 760 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
LMO3Q8TAP4 CMPK1-204ENST00000450808 950 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
LMO3Q8TAP4 TNNT2-214ENST00000458432 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
LMO3Q8TAP4 GDNF-207ENST00000515058 764 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
LMO3Q8TAP4 AC093367.1-201ENST00000517332 420 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
LMO3Q8TAP4 RBMX-209ENST00000565438 1292 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
LMO3Q8TAP4 AC009065.6-201ENST00000568795 456 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
LMO3Q8TAP4 BRSK1-203ENST00000585418 1104 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
LMO3Q8TAP4 SLC27A5-204ENST00000594786 643 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
LMO3Q8TAP4 ZNF674-AS1-202ENST00000609887 672 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
LMO3Q8TAP4 CR589904.1-202ENST00000611154 660 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
LMO3Q8TAP4 ERAS-202ENST00000636362 826 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
LMO3Q8TAP4 PRPS2-202ENST00000380668 2511 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
LMO3Q8TAP4 DHX34-201ENST00000328771 4372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
LMO3Q8TAP4 RBM3-201ENST00000354480 1884 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
LMO3Q8TAP4 SIGLEC10-209ENST00000525998 1841 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
LMO3Q8TAP4 TMEM248-201ENST00000341567 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
LMO3Q8TAP4 OTULIN-201ENST00000284274 7800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
LMO3Q8TAP4 ATG13-211ENST00000528494 2351 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
LMO3Q8TAP4 HMGCS1-201ENST00000325110 3506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
LMO3Q8TAP4 CT55-202ENST00000344129 1728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
LMO3Q8TAP4 SYNJ2-208ENST00000640338 3959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
LMO3Q8TAP4 NBEA-201ENST00000310336 10794 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
LMO3Q8TAP4 ORC6-204ENST00000566860 1699 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
LMO3Q8TAP4 CRBN-215ENST00000639284 2223 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
LMO3Q8TAP4 HPGD-214ENST00000542498 2786 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
LMO3Q8TAP4 TMEM164-203ENST00000372072 4975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
LMO3Q8TAP4 JMJD6-208ENST00000617192 5517 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
LMO3Q8TAP4 DGKH-202ENST00000337343 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
LMO3Q8TAP4 KIAA0319-201ENST00000378214 6802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
LMO3Q8TAP4 CRYBG2-201ENST00000308182 5245 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
LMO3Q8TAP4 GOLGA6L10-209ENST00000621197 4160 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
LMO3Q8TAP4 MAP7D3-201ENST00000316077 4567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
LMO3Q8TAP4 IMPDH1P8-201ENST00000413639 1525 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
LMO3Q8TAP4 UMODL1-203ENST00000400424 5516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
LMO3Q8TAP4 GLIS3-202ENST00000381971 3961 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
LMO3Q8TAP4 RBM15-205ENST00000618772 3431 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
LMO3Q8TAP4 GTF2IRD1P1-202ENST00000457166 2426 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
LMO3Q8TAP4 TASP1-201ENST00000337743 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
LMO3Q8TAP4 TEX35-203ENST00000367641 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
LMO3Q8TAP4 ANGEL1-205ENST00000557179 1427 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
LMO3Q8TAP4 PXDN-201ENST00000252804 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
LMO3Q8TAP4 SLC12A7-201ENST00000264930 5280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
LMO3Q8TAP4 AC122688.3-201ENST00000623804 3467 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
LMO3Q8TAP4 NCOA7-203ENST00000392477 6457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
LMO3Q8TAP4 AP000487.2-201ENST00000324630 394 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
LMO3Q8TAP4 SNORA52-201ENST00000362915 134 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
LMO3Q8TAP4 SDHAF4-201ENST00000370474 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
LMO3Q8TAP4 CELA2B-201ENST00000375910 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
LMO3Q8TAP4 PUDP-201ENST00000381077 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
LMO3Q8TAP4 FOLR1-204ENST00000393681 1061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
LMO3Q8TAP4 ZNF286A-201ENST00000395893 654 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
LMO3Q8TAP4 CTHRC1-202ENST00000415886 571 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
LMO3Q8TAP4 AC027612.2-201ENST00000436174 1145 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
LMO3Q8TAP4 AC006328.1-201ENST00000437571 379 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
LMO3Q8TAP4 Metazoa_SRP.100-201ENST00000447610 282 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
LMO3Q8TAP4 AC093700.1-201ENST00000503348 717 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
LMO3Q8TAP4 AC010267.1-201ENST00000508636 553 ntTSL 4 BASIC13.74□□□□□ -0.21
LMO3Q8TAP4 AC010395.2-201ENST00000509899 904 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
LMO3Q8TAP4 BANF1-205ENST00000527348 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
LMO3Q8TAP4 EIF3K-202ENST00000538434 966 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
LMO3Q8TAP4 ZNF124-206ENST00000543802 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
LMO3Q8TAP4 GABARAPL1-213ENST00000544284 531 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
LMO3Q8TAP4 AL391832.3-201ENST00000549744 846 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
LMO3Q8TAP4 AC073573.1-201ENST00000550908 481 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
LMO3Q8TAP4 AC055717.2-201ENST00000561864 577 ntTSL 4 BASIC13.74□□□□□ -0.21
LMO3Q8TAP4 AC079414.2-201ENST00000567157 1104 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
LMO3Q8TAP4 INCA1-202ENST00000574617 1260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
LMO3Q8TAP4 INCA1-204ENST00000576820 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
LMO3Q8TAP4 FXYD3-211ENST00000604804 564 ntTSL 4 BASIC13.74□□□□□ -0.21
LMO3Q8TAP4 SERPING1-213ENST00000619430 634 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
LMO3Q8TAP4 AC245595.2-201ENST00000620141 1144 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
LMO3Q8TAP4 DNAJC17-212ENST00000627802 428 ntTSL 4 BASIC13.74□□□□□ -0.21
LMO3Q8TAP4 XRN1-203ENST00000463916 2075 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
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