Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6H8

GJA3, Gap junction alpha-3 protein, humanhuman

Predictions only

Length 435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJA3Q9Y6H8 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
GJA3Q9Y6H8 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
GJA3Q9Y6H8 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
GJA3Q9Y6H8 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
GJA3Q9Y6H8 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
GJA3Q9Y6H8 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC26.7■■□□□ 1.87
GJA3Q9Y6H8 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
GJA3Q9Y6H8 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
GJA3Q9Y6H8 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
GJA3Q9Y6H8 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
GJA3Q9Y6H8 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
GJA3Q9Y6H8 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
GJA3Q9Y6H8 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
GJA3Q9Y6H8 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
GJA3Q9Y6H8 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
GJA3Q9Y6H8 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
GJA3Q9Y6H8 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
GJA3Q9Y6H8 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
GJA3Q9Y6H8 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
GJA3Q9Y6H8 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
GJA3Q9Y6H8 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
GJA3Q9Y6H8 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
GJA3Q9Y6H8 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
GJA3Q9Y6H8 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
GJA3Q9Y6H8 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
GJA3Q9Y6H8 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
GJA3Q9Y6H8 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
GJA3Q9Y6H8 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
GJA3Q9Y6H8 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
GJA3Q9Y6H8 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
GJA3Q9Y6H8 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
GJA3Q9Y6H8 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
GJA3Q9Y6H8 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
GJA3Q9Y6H8 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
GJA3Q9Y6H8 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
GJA3Q9Y6H8 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
GJA3Q9Y6H8 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
GJA3Q9Y6H8 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
GJA3Q9Y6H8 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
GJA3Q9Y6H8 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
GJA3Q9Y6H8 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
GJA3Q9Y6H8 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
GJA3Q9Y6H8 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
GJA3Q9Y6H8 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
GJA3Q9Y6H8 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.66■■□□□ 1.86
GJA3Q9Y6H8 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
GJA3Q9Y6H8 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
GJA3Q9Y6H8 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
GJA3Q9Y6H8 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
GJA3Q9Y6H8 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
GJA3Q9Y6H8 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
GJA3Q9Y6H8 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
GJA3Q9Y6H8 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
GJA3Q9Y6H8 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
GJA3Q9Y6H8 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
GJA3Q9Y6H8 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
GJA3Q9Y6H8 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
GJA3Q9Y6H8 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC26.64■■□□□ 1.86
GJA3Q9Y6H8 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC26.64■■□□□ 1.85
GJA3Q9Y6H8 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
GJA3Q9Y6H8 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
GJA3Q9Y6H8 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
GJA3Q9Y6H8 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
GJA3Q9Y6H8 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
GJA3Q9Y6H8 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
GJA3Q9Y6H8 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
GJA3Q9Y6H8 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
GJA3Q9Y6H8 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
GJA3Q9Y6H8 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
GJA3Q9Y6H8 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
GJA3Q9Y6H8 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
GJA3Q9Y6H8 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
GJA3Q9Y6H8 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
GJA3Q9Y6H8 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
GJA3Q9Y6H8 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
GJA3Q9Y6H8 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
GJA3Q9Y6H8 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
GJA3Q9Y6H8 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
GJA3Q9Y6H8 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
GJA3Q9Y6H8 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
GJA3Q9Y6H8 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
GJA3Q9Y6H8 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
GJA3Q9Y6H8 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
GJA3Q9Y6H8 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC26.62■■□□□ 1.85
GJA3Q9Y6H8 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
GJA3Q9Y6H8 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
GJA3Q9Y6H8 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
GJA3Q9Y6H8 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC26.61■■□□□ 1.85
GJA3Q9Y6H8 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
GJA3Q9Y6H8 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
GJA3Q9Y6H8 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
GJA3Q9Y6H8 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
GJA3Q9Y6H8 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
GJA3Q9Y6H8 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
GJA3Q9Y6H8 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
GJA3Q9Y6H8 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
GJA3Q9Y6H8 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
GJA3Q9Y6H8 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
GJA3Q9Y6H8 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
GJA3Q9Y6H8 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.6 ms