Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5E7

PCDHB2, Protocadherin beta-2, humanhuman

Predictions only

Length 798 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCDHB2Q9Y5E7 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PCDHB2Q9Y5E7 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PCDHB2Q9Y5E7 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PCDHB2Q9Y5E7 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PCDHB2Q9Y5E7 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PCDHB2Q9Y5E7 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PCDHB2Q9Y5E7 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PCDHB2Q9Y5E7 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
PCDHB2Q9Y5E7 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PCDHB2Q9Y5E7 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PCDHB2Q9Y5E7 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PCDHB2Q9Y5E7 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PCDHB2Q9Y5E7 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PCDHB2Q9Y5E7 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PCDHB2Q9Y5E7 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PCDHB2Q9Y5E7 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PCDHB2Q9Y5E7 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PCDHB2Q9Y5E7 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PCDHB2Q9Y5E7 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PCDHB2Q9Y5E7 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
PCDHB2Q9Y5E7 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PCDHB2Q9Y5E7 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PCDHB2Q9Y5E7 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PCDHB2Q9Y5E7 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PCDHB2Q9Y5E7 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PCDHB2Q9Y5E7 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PCDHB2Q9Y5E7 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PCDHB2Q9Y5E7 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PCDHB2Q9Y5E7 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PCDHB2Q9Y5E7 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PCDHB2Q9Y5E7 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PCDHB2Q9Y5E7 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PCDHB2Q9Y5E7 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PCDHB2Q9Y5E7 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PCDHB2Q9Y5E7 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PCDHB2Q9Y5E7 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PCDHB2Q9Y5E7 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
PCDHB2Q9Y5E7 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PCDHB2Q9Y5E7 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PCDHB2Q9Y5E7 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PCDHB2Q9Y5E7 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PCDHB2Q9Y5E7 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
PCDHB2Q9Y5E7 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PCDHB2Q9Y5E7 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PCDHB2Q9Y5E7 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
PCDHB2Q9Y5E7 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PCDHB2Q9Y5E7 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
PCDHB2Q9Y5E7 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
PCDHB2Q9Y5E7 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.44
PCDHB2Q9Y5E7 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
PCDHB2Q9Y5E7 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PCDHB2Q9Y5E7 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PCDHB2Q9Y5E7 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PCDHB2Q9Y5E7 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
PCDHB2Q9Y5E7 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
PCDHB2Q9Y5E7 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
PCDHB2Q9Y5E7 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PCDHB2Q9Y5E7 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PCDHB2Q9Y5E7 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PCDHB2Q9Y5E7 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PCDHB2Q9Y5E7 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
PCDHB2Q9Y5E7 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PCDHB2Q9Y5E7 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PCDHB2Q9Y5E7 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PCDHB2Q9Y5E7 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PCDHB2Q9Y5E7 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PCDHB2Q9Y5E7 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PCDHB2Q9Y5E7 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
PCDHB2Q9Y5E7 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PCDHB2Q9Y5E7 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PCDHB2Q9Y5E7 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PCDHB2Q9Y5E7 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PCDHB2Q9Y5E7 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PCDHB2Q9Y5E7 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PCDHB2Q9Y5E7 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PCDHB2Q9Y5E7 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PCDHB2Q9Y5E7 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PCDHB2Q9Y5E7 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PCDHB2Q9Y5E7 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PCDHB2Q9Y5E7 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PCDHB2Q9Y5E7 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PCDHB2Q9Y5E7 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PCDHB2Q9Y5E7 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PCDHB2Q9Y5E7 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PCDHB2Q9Y5E7 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PCDHB2Q9Y5E7 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PCDHB2Q9Y5E7 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PCDHB2Q9Y5E7 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PCDHB2Q9Y5E7 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PCDHB2Q9Y5E7 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
PCDHB2Q9Y5E7 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PCDHB2Q9Y5E7 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PCDHB2Q9Y5E7 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PCDHB2Q9Y5E7 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PCDHB2Q9Y5E7 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PCDHB2Q9Y5E7 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PCDHB2Q9Y5E7 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PCDHB2Q9Y5E7 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PCDHB2Q9Y5E7 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PCDHB2Q9Y5E7 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms