Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2T7

YBX2, Y-box-binding protein 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 364 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
YBX2Q9Y2T7 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
YBX2Q9Y2T7 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
YBX2Q9Y2T7 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
YBX2Q9Y2T7 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
YBX2Q9Y2T7 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
YBX2Q9Y2T7 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
YBX2Q9Y2T7 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
YBX2Q9Y2T7 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
YBX2Q9Y2T7 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
YBX2Q9Y2T7 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
YBX2Q9Y2T7 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
YBX2Q9Y2T7 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
YBX2Q9Y2T7 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
YBX2Q9Y2T7 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
YBX2Q9Y2T7 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
YBX2Q9Y2T7 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
YBX2Q9Y2T7 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
YBX2Q9Y2T7 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
YBX2Q9Y2T7 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
YBX2Q9Y2T7 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
YBX2Q9Y2T7 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
YBX2Q9Y2T7 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
YBX2Q9Y2T7 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
YBX2Q9Y2T7 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
YBX2Q9Y2T7 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
YBX2Q9Y2T7 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
YBX2Q9Y2T7 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
YBX2Q9Y2T7 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
YBX2Q9Y2T7 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
YBX2Q9Y2T7 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
YBX2Q9Y2T7 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
YBX2Q9Y2T7 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
YBX2Q9Y2T7 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
YBX2Q9Y2T7 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
YBX2Q9Y2T7 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
YBX2Q9Y2T7 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
YBX2Q9Y2T7 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
YBX2Q9Y2T7 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
YBX2Q9Y2T7 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
YBX2Q9Y2T7 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC23.68■■□□□ 1.38
YBX2Q9Y2T7 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
YBX2Q9Y2T7 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
YBX2Q9Y2T7 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
YBX2Q9Y2T7 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
YBX2Q9Y2T7 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
YBX2Q9Y2T7 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
YBX2Q9Y2T7 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
YBX2Q9Y2T7 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
YBX2Q9Y2T7 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
YBX2Q9Y2T7 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
YBX2Q9Y2T7 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC23.67■■□□□ 1.38
YBX2Q9Y2T7 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
YBX2Q9Y2T7 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
YBX2Q9Y2T7 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
YBX2Q9Y2T7 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
YBX2Q9Y2T7 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
YBX2Q9Y2T7 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
YBX2Q9Y2T7 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
YBX2Q9Y2T7 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
YBX2Q9Y2T7 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
YBX2Q9Y2T7 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
YBX2Q9Y2T7 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
YBX2Q9Y2T7 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
YBX2Q9Y2T7 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
YBX2Q9Y2T7 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
YBX2Q9Y2T7 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
YBX2Q9Y2T7 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
YBX2Q9Y2T7 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
YBX2Q9Y2T7 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
YBX2Q9Y2T7 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
YBX2Q9Y2T7 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
YBX2Q9Y2T7 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
YBX2Q9Y2T7 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC23.65■■□□□ 1.38
YBX2Q9Y2T7 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
YBX2Q9Y2T7 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
YBX2Q9Y2T7 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
YBX2Q9Y2T7 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
YBX2Q9Y2T7 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
YBX2Q9Y2T7 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
YBX2Q9Y2T7 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
YBX2Q9Y2T7 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
YBX2Q9Y2T7 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
YBX2Q9Y2T7 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.37
YBX2Q9Y2T7 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
YBX2Q9Y2T7 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
YBX2Q9Y2T7 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
YBX2Q9Y2T7 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
YBX2Q9Y2T7 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
YBX2Q9Y2T7 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
YBX2Q9Y2T7 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
YBX2Q9Y2T7 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
YBX2Q9Y2T7 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC23.63■■□□□ 1.37
YBX2Q9Y2T7 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
YBX2Q9Y2T7 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
YBX2Q9Y2T7 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
YBX2Q9Y2T7 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
YBX2Q9Y2T7 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
YBX2Q9Y2T7 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
YBX2Q9Y2T7 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
YBX2Q9Y2T7 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.9 ms