Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2L5

TRAPPC8, Trafficking protein particle complex subunit 8, humanhuman

Predictions only

Length 1,435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC8Q9Y2L5 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
TRAPPC8Q9Y2L5 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
TRAPPC8Q9Y2L5 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
TRAPPC8Q9Y2L5 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.44■■■□□ 2.94
TRAPPC8Q9Y2L5 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC33.44■■■□□ 2.94
TRAPPC8Q9Y2L5 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC33.44■■■□□ 2.94
TRAPPC8Q9Y2L5 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC33.44■■■□□ 2.94
TRAPPC8Q9Y2L5 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
TRAPPC8Q9Y2L5 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC33.43■■■□□ 2.94
TRAPPC8Q9Y2L5 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
TRAPPC8Q9Y2L5 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC33.43■■■□□ 2.94
TRAPPC8Q9Y2L5 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC33.43■■■□□ 2.94
TRAPPC8Q9Y2L5 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC33.43■■■□□ 2.94
TRAPPC8Q9Y2L5 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC33.43■■■□□ 2.94
TRAPPC8Q9Y2L5 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
TRAPPC8Q9Y2L5 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
TRAPPC8Q9Y2L5 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
TRAPPC8Q9Y2L5 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
TRAPPC8Q9Y2L5 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.42■■■□□ 2.94
TRAPPC8Q9Y2L5 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
TRAPPC8Q9Y2L5 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
TRAPPC8Q9Y2L5 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC33.42■■■□□ 2.94
TRAPPC8Q9Y2L5 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
TRAPPC8Q9Y2L5 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
TRAPPC8Q9Y2L5 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
TRAPPC8Q9Y2L5 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
TRAPPC8Q9Y2L5 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC33.41■■■□□ 2.94
TRAPPC8Q9Y2L5 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC33.41■■■□□ 2.94
TRAPPC8Q9Y2L5 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC33.41■■■□□ 2.94
TRAPPC8Q9Y2L5 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC33.41■■■□□ 2.94
TRAPPC8Q9Y2L5 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC33.41■■■□□ 2.94
TRAPPC8Q9Y2L5 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
TRAPPC8Q9Y2L5 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC33.4■■■□□ 2.94
TRAPPC8Q9Y2L5 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.4■■■□□ 2.94
TRAPPC8Q9Y2L5 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
TRAPPC8Q9Y2L5 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
TRAPPC8Q9Y2L5 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.4■■■□□ 2.94
TRAPPC8Q9Y2L5 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC33.4■■■□□ 2.94
TRAPPC8Q9Y2L5 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
TRAPPC8Q9Y2L5 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.4■■■□□ 2.94
TRAPPC8Q9Y2L5 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
TRAPPC8Q9Y2L5 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
TRAPPC8Q9Y2L5 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC33.39■■■□□ 2.94
TRAPPC8Q9Y2L5 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
TRAPPC8Q9Y2L5 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
TRAPPC8Q9Y2L5 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
TRAPPC8Q9Y2L5 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC33.39■■■□□ 2.94
TRAPPC8Q9Y2L5 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC33.39■■■□□ 2.94
TRAPPC8Q9Y2L5 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
TRAPPC8Q9Y2L5 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC33.39■■■□□ 2.94
TRAPPC8Q9Y2L5 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
TRAPPC8Q9Y2L5 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC33.38■■■□□ 2.93
TRAPPC8Q9Y2L5 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.38■■■□□ 2.93
TRAPPC8Q9Y2L5 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
TRAPPC8Q9Y2L5 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC33.38■■■□□ 2.93
TRAPPC8Q9Y2L5 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC33.38■■■□□ 2.93
TRAPPC8Q9Y2L5 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC33.38■■■□□ 2.93
TRAPPC8Q9Y2L5 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC33.38■■■□□ 2.93
TRAPPC8Q9Y2L5 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
TRAPPC8Q9Y2L5 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
TRAPPC8Q9Y2L5 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
TRAPPC8Q9Y2L5 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC33.37■■■□□ 2.93
TRAPPC8Q9Y2L5 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC33.37■■■□□ 2.93
TRAPPC8Q9Y2L5 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC33.37■■■□□ 2.93
TRAPPC8Q9Y2L5 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
TRAPPC8Q9Y2L5 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
TRAPPC8Q9Y2L5 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.37■■■□□ 2.93
TRAPPC8Q9Y2L5 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
TRAPPC8Q9Y2L5 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
TRAPPC8Q9Y2L5 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
TRAPPC8Q9Y2L5 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC33.36■■■□□ 2.93
TRAPPC8Q9Y2L5 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC33.36■■■□□ 2.93
TRAPPC8Q9Y2L5 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC33.36■■■□□ 2.93
TRAPPC8Q9Y2L5 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC33.35■■■□□ 2.93
TRAPPC8Q9Y2L5 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC33.35■■■□□ 2.93
TRAPPC8Q9Y2L5 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
TRAPPC8Q9Y2L5 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
TRAPPC8Q9Y2L5 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC33.35■■■□□ 2.93
TRAPPC8Q9Y2L5 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC33.35■■■□□ 2.93
TRAPPC8Q9Y2L5 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
TRAPPC8Q9Y2L5 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
TRAPPC8Q9Y2L5 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
TRAPPC8Q9Y2L5 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC33.34■■■□□ 2.93
TRAPPC8Q9Y2L5 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
TRAPPC8Q9Y2L5 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC33.34■■■□□ 2.93
TRAPPC8Q9Y2L5 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
TRAPPC8Q9Y2L5 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC33.34■■■□□ 2.93
TRAPPC8Q9Y2L5 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
TRAPPC8Q9Y2L5 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
TRAPPC8Q9Y2L5 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC33.34■■■□□ 2.93
TRAPPC8Q9Y2L5 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC33.34■■■□□ 2.93
TRAPPC8Q9Y2L5 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC33.34■■■□□ 2.93
TRAPPC8Q9Y2L5 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
TRAPPC8Q9Y2L5 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC33.34■■■□□ 2.93
TRAPPC8Q9Y2L5 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
TRAPPC8Q9Y2L5 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC33.33■■■□□ 2.93
TRAPPC8Q9Y2L5 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.33■■■□□ 2.93
TRAPPC8Q9Y2L5 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC33.33■■■□□ 2.93
TRAPPC8Q9Y2L5 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC33.33■■■□□ 2.93
TRAPPC8Q9Y2L5 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC33.33■■■□□ 2.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.5 ms