Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y235

APOBEC2, C->U-editing enzyme APOBEC-2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC2Q9Y235 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
APOBEC2Q9Y235 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
APOBEC2Q9Y235 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
APOBEC2Q9Y235 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
APOBEC2Q9Y235 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
APOBEC2Q9Y235 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
APOBEC2Q9Y235 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
APOBEC2Q9Y235 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
APOBEC2Q9Y235 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
APOBEC2Q9Y235 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
APOBEC2Q9Y235 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
APOBEC2Q9Y235 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
APOBEC2Q9Y235 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
APOBEC2Q9Y235 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
APOBEC2Q9Y235 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
APOBEC2Q9Y235 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
APOBEC2Q9Y235 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
APOBEC2Q9Y235 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
APOBEC2Q9Y235 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
APOBEC2Q9Y235 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
APOBEC2Q9Y235 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
APOBEC2Q9Y235 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
APOBEC2Q9Y235 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
APOBEC2Q9Y235 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
APOBEC2Q9Y235 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
APOBEC2Q9Y235 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
APOBEC2Q9Y235 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
APOBEC2Q9Y235 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
APOBEC2Q9Y235 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
APOBEC2Q9Y235 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
APOBEC2Q9Y235 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
APOBEC2Q9Y235 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
APOBEC2Q9Y235 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
APOBEC2Q9Y235 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
APOBEC2Q9Y235 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
APOBEC2Q9Y235 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
APOBEC2Q9Y235 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
APOBEC2Q9Y235 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
APOBEC2Q9Y235 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
APOBEC2Q9Y235 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
APOBEC2Q9Y235 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
APOBEC2Q9Y235 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
APOBEC2Q9Y235 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
APOBEC2Q9Y235 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
APOBEC2Q9Y235 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
APOBEC2Q9Y235 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
APOBEC2Q9Y235 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
APOBEC2Q9Y235 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
APOBEC2Q9Y235 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
APOBEC2Q9Y235 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
APOBEC2Q9Y235 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
APOBEC2Q9Y235 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
APOBEC2Q9Y235 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
APOBEC2Q9Y235 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
APOBEC2Q9Y235 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
APOBEC2Q9Y235 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
APOBEC2Q9Y235 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
APOBEC2Q9Y235 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
APOBEC2Q9Y235 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
APOBEC2Q9Y235 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
APOBEC2Q9Y235 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
APOBEC2Q9Y235 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
APOBEC2Q9Y235 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
APOBEC2Q9Y235 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
APOBEC2Q9Y235 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
APOBEC2Q9Y235 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
APOBEC2Q9Y235 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
APOBEC2Q9Y235 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
APOBEC2Q9Y235 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
APOBEC2Q9Y235 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
APOBEC2Q9Y235 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
APOBEC2Q9Y235 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
APOBEC2Q9Y235 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
APOBEC2Q9Y235 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
APOBEC2Q9Y235 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
APOBEC2Q9Y235 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
APOBEC2Q9Y235 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
APOBEC2Q9Y235 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
APOBEC2Q9Y235 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
APOBEC2Q9Y235 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
APOBEC2Q9Y235 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
APOBEC2Q9Y235 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
APOBEC2Q9Y235 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
APOBEC2Q9Y235 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
APOBEC2Q9Y235 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
APOBEC2Q9Y235 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
APOBEC2Q9Y235 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
APOBEC2Q9Y235 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
APOBEC2Q9Y235 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
APOBEC2Q9Y235 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
APOBEC2Q9Y235 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
APOBEC2Q9Y235 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
APOBEC2Q9Y235 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
APOBEC2Q9Y235 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
APOBEC2Q9Y235 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
APOBEC2Q9Y235 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
APOBEC2Q9Y235 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
APOBEC2Q9Y235 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
APOBEC2Q9Y235 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
APOBEC2Q9Y235 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms