Protein–RNA interactions for Protein: Q9UP95

SLC12A4, Solute carrier family 12 member 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,085 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC12A4Q9UP95 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SLC12A4Q9UP95 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SLC12A4Q9UP95 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SLC12A4Q9UP95 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
SLC12A4Q9UP95 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SLC12A4Q9UP95 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SLC12A4Q9UP95 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SLC12A4Q9UP95 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SLC12A4Q9UP95 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
SLC12A4Q9UP95 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SLC12A4Q9UP95 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SLC12A4Q9UP95 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SLC12A4Q9UP95 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SLC12A4Q9UP95 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SLC12A4Q9UP95 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SLC12A4Q9UP95 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SLC12A4Q9UP95 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SLC12A4Q9UP95 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
SLC12A4Q9UP95 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SLC12A4Q9UP95 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SLC12A4Q9UP95 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SLC12A4Q9UP95 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SLC12A4Q9UP95 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SLC12A4Q9UP95 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SLC12A4Q9UP95 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SLC12A4Q9UP95 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SLC12A4Q9UP95 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SLC12A4Q9UP95 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SLC12A4Q9UP95 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SLC12A4Q9UP95 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SLC12A4Q9UP95 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SLC12A4Q9UP95 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SLC12A4Q9UP95 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SLC12A4Q9UP95 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SLC12A4Q9UP95 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SLC12A4Q9UP95 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SLC12A4Q9UP95 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SLC12A4Q9UP95 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SLC12A4Q9UP95 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SLC12A4Q9UP95 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SLC12A4Q9UP95 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SLC12A4Q9UP95 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SLC12A4Q9UP95 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SLC12A4Q9UP95 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SLC12A4Q9UP95 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SLC12A4Q9UP95 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SLC12A4Q9UP95 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SLC12A4Q9UP95 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SLC12A4Q9UP95 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SLC12A4Q9UP95 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SLC12A4Q9UP95 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SLC12A4Q9UP95 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SLC12A4Q9UP95 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SLC12A4Q9UP95 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
SLC12A4Q9UP95 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
SLC12A4Q9UP95 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
SLC12A4Q9UP95 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
SLC12A4Q9UP95 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SLC12A4Q9UP95 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SLC12A4Q9UP95 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SLC12A4Q9UP95 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SLC12A4Q9UP95 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SLC12A4Q9UP95 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SLC12A4Q9UP95 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SLC12A4Q9UP95 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SLC12A4Q9UP95 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SLC12A4Q9UP95 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SLC12A4Q9UP95 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SLC12A4Q9UP95 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SLC12A4Q9UP95 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
SLC12A4Q9UP95 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SLC12A4Q9UP95 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SLC12A4Q9UP95 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SLC12A4Q9UP95 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SLC12A4Q9UP95 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SLC12A4Q9UP95 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SLC12A4Q9UP95 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SLC12A4Q9UP95 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SLC12A4Q9UP95 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SLC12A4Q9UP95 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
SLC12A4Q9UP95 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SLC12A4Q9UP95 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SLC12A4Q9UP95 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SLC12A4Q9UP95 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SLC12A4Q9UP95 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SLC12A4Q9UP95 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SLC12A4Q9UP95 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SLC12A4Q9UP95 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SLC12A4Q9UP95 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SLC12A4Q9UP95 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SLC12A4Q9UP95 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SLC12A4Q9UP95 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SLC12A4Q9UP95 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SLC12A4Q9UP95 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SLC12A4Q9UP95 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SLC12A4Q9UP95 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SLC12A4Q9UP95 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SLC12A4Q9UP95 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SLC12A4Q9UP95 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SLC12A4Q9UP95 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.2 ms