Protein–RNA interactions for Protein: Q9UL51

HCN2, Potassium/sodium hyperpolarization-activated cyclic nucleotide-gated channel 2, humanhuman

Predictions only

Length 889 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HCN2Q9UL51 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
HCN2Q9UL51 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
HCN2Q9UL51 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC22.39■■□□□ 1.17
HCN2Q9UL51 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
HCN2Q9UL51 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
HCN2Q9UL51 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
HCN2Q9UL51 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
HCN2Q9UL51 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
HCN2Q9UL51 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
HCN2Q9UL51 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
HCN2Q9UL51 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
HCN2Q9UL51 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
HCN2Q9UL51 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
HCN2Q9UL51 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
HCN2Q9UL51 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
HCN2Q9UL51 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
HCN2Q9UL51 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
HCN2Q9UL51 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
HCN2Q9UL51 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HCN2Q9UL51 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
HCN2Q9UL51 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
HCN2Q9UL51 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
HCN2Q9UL51 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HCN2Q9UL51 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HCN2Q9UL51 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HCN2Q9UL51 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HCN2Q9UL51 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HCN2Q9UL51 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HCN2Q9UL51 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
HCN2Q9UL51 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
HCN2Q9UL51 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
HCN2Q9UL51 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
HCN2Q9UL51 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
HCN2Q9UL51 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
HCN2Q9UL51 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HCN2Q9UL51 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HCN2Q9UL51 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
HCN2Q9UL51 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
HCN2Q9UL51 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HCN2Q9UL51 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
HCN2Q9UL51 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HCN2Q9UL51 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
HCN2Q9UL51 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
HCN2Q9UL51 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HCN2Q9UL51 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
HCN2Q9UL51 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
HCN2Q9UL51 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HCN2Q9UL51 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
HCN2Q9UL51 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HCN2Q9UL51 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
HCN2Q9UL51 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HCN2Q9UL51 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HCN2Q9UL51 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HCN2Q9UL51 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HCN2Q9UL51 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
HCN2Q9UL51 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HCN2Q9UL51 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HCN2Q9UL51 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HCN2Q9UL51 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
HCN2Q9UL51 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
HCN2Q9UL51 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
HCN2Q9UL51 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HCN2Q9UL51 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
HCN2Q9UL51 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
HCN2Q9UL51 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HCN2Q9UL51 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
HCN2Q9UL51 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HCN2Q9UL51 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HCN2Q9UL51 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HCN2Q9UL51 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
HCN2Q9UL51 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
HCN2Q9UL51 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
HCN2Q9UL51 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
HCN2Q9UL51 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HCN2Q9UL51 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
HCN2Q9UL51 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
HCN2Q9UL51 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
HCN2Q9UL51 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
HCN2Q9UL51 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
HCN2Q9UL51 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
HCN2Q9UL51 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
HCN2Q9UL51 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
HCN2Q9UL51 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
HCN2Q9UL51 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
HCN2Q9UL51 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
HCN2Q9UL51 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
HCN2Q9UL51 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
HCN2Q9UL51 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
HCN2Q9UL51 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
HCN2Q9UL51 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC22.31■■□□□ 1.16
HCN2Q9UL51 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HCN2Q9UL51 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HCN2Q9UL51 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HCN2Q9UL51 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
HCN2Q9UL51 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HCN2Q9UL51 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
HCN2Q9UL51 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HCN2Q9UL51 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
HCN2Q9UL51 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC22.31■■□□□ 1.16
HCN2Q9UL51 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17 ms