Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHC1

MLH3, DNA mismatch repair protein Mlh3, humanhuman

Predictions only

Length 1,453 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MLH3Q9UHC1 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
MLH3Q9UHC1 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC33.23■■■□□ 2.91
MLH3Q9UHC1 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC33.23■■■□□ 2.91
MLH3Q9UHC1 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC33.23■■■□□ 2.91
MLH3Q9UHC1 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
MLH3Q9UHC1 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC33.22■■■□□ 2.91
MLH3Q9UHC1 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
MLH3Q9UHC1 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC33.22■■■□□ 2.91
MLH3Q9UHC1 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC33.22■■■□□ 2.91
MLH3Q9UHC1 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.22■■■□□ 2.91
MLH3Q9UHC1 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC33.22■■■□□ 2.91
MLH3Q9UHC1 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.22■■■□□ 2.91
MLH3Q9UHC1 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC33.22■■■□□ 2.91
MLH3Q9UHC1 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
MLH3Q9UHC1 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
MLH3Q9UHC1 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.21■■■□□ 2.91
MLH3Q9UHC1 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
MLH3Q9UHC1 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
MLH3Q9UHC1 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.21■■■□□ 2.91
MLH3Q9UHC1 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC33.21■■■□□ 2.91
MLH3Q9UHC1 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
MLH3Q9UHC1 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
MLH3Q9UHC1 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC33.21■■■□□ 2.91
MLH3Q9UHC1 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
MLH3Q9UHC1 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC33.2■■■□□ 2.91
MLH3Q9UHC1 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
MLH3Q9UHC1 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
MLH3Q9UHC1 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC33.2■■■□□ 2.91
MLH3Q9UHC1 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.2■■■□□ 2.91
MLH3Q9UHC1 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
MLH3Q9UHC1 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC33.2■■■□□ 2.91
MLH3Q9UHC1 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.9
MLH3Q9UHC1 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC33.19■■■□□ 2.9
MLH3Q9UHC1 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC33.19■■■□□ 2.9
MLH3Q9UHC1 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC33.19■■■□□ 2.9
MLH3Q9UHC1 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
MLH3Q9UHC1 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.19■■■□□ 2.9
MLH3Q9UHC1 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
MLH3Q9UHC1 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC33.18■■■□□ 2.9
MLH3Q9UHC1 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
MLH3Q9UHC1 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC33.18■■■□□ 2.9
MLH3Q9UHC1 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.18■■■□□ 2.9
MLH3Q9UHC1 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
MLH3Q9UHC1 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC33.18■■■□□ 2.9
MLH3Q9UHC1 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
MLH3Q9UHC1 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
MLH3Q9UHC1 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.17■■■□□ 2.9
MLH3Q9UHC1 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
MLH3Q9UHC1 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.17■■■□□ 2.9
MLH3Q9UHC1 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC33.17■■■□□ 2.9
MLH3Q9UHC1 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC33.17■■■□□ 2.9
MLH3Q9UHC1 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.17■■■□□ 2.9
MLH3Q9UHC1 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC33.16■■■□□ 2.9
MLH3Q9UHC1 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC33.16■■■□□ 2.9
MLH3Q9UHC1 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC33.16■■■□□ 2.9
MLH3Q9UHC1 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC33.16■■■□□ 2.9
MLH3Q9UHC1 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC33.15■■■□□ 2.9
MLH3Q9UHC1 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
MLH3Q9UHC1 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC33.15■■■□□ 2.9
MLH3Q9UHC1 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC33.15■■■□□ 2.9
MLH3Q9UHC1 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC33.15■■■□□ 2.9
MLH3Q9UHC1 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
MLH3Q9UHC1 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
MLH3Q9UHC1 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
MLH3Q9UHC1 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
MLH3Q9UHC1 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
MLH3Q9UHC1 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
MLH3Q9UHC1 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.14■■■□□ 2.9
MLH3Q9UHC1 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
MLH3Q9UHC1 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
MLH3Q9UHC1 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
MLH3Q9UHC1 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC33.13■■■□□ 2.89
MLH3Q9UHC1 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC33.13■■■□□ 2.89
MLH3Q9UHC1 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
MLH3Q9UHC1 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
MLH3Q9UHC1 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
MLH3Q9UHC1 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
MLH3Q9UHC1 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
MLH3Q9UHC1 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC33.12■■■□□ 2.89
MLH3Q9UHC1 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
MLH3Q9UHC1 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC33.12■■■□□ 2.89
MLH3Q9UHC1 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC33.12■■■□□ 2.89
MLH3Q9UHC1 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
MLH3Q9UHC1 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.12■■■□□ 2.89
MLH3Q9UHC1 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
MLH3Q9UHC1 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC33.12■■■□□ 2.89
MLH3Q9UHC1 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
MLH3Q9UHC1 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
MLH3Q9UHC1 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC33.12■■■□□ 2.89
MLH3Q9UHC1 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC33.12■■■□□ 2.89
MLH3Q9UHC1 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.12■■■□□ 2.89
MLH3Q9UHC1 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC33.12■■■□□ 2.89
MLH3Q9UHC1 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC33.12■■■□□ 2.89
MLH3Q9UHC1 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
MLH3Q9UHC1 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.11■■■□□ 2.89
MLH3Q9UHC1 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC33.11■■■□□ 2.89
MLH3Q9UHC1 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC33.11■■■□□ 2.89
MLH3Q9UHC1 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.11■■■□□ 2.89
MLH3Q9UHC1 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
MLH3Q9UHC1 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC33.11■■■□□ 2.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms