Protein–RNA interactions for Protein: Q9UGU5

HMGXB4, HMG domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 601 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGXB4Q9UGU5 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
HMGXB4Q9UGU5 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
HMGXB4Q9UGU5 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
HMGXB4Q9UGU5 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
HMGXB4Q9UGU5 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
HMGXB4Q9UGU5 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
HMGXB4Q9UGU5 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
HMGXB4Q9UGU5 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
HMGXB4Q9UGU5 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
HMGXB4Q9UGU5 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
HMGXB4Q9UGU5 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
HMGXB4Q9UGU5 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
HMGXB4Q9UGU5 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
HMGXB4Q9UGU5 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
HMGXB4Q9UGU5 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
HMGXB4Q9UGU5 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
HMGXB4Q9UGU5 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
HMGXB4Q9UGU5 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
HMGXB4Q9UGU5 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
HMGXB4Q9UGU5 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
HMGXB4Q9UGU5 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
HMGXB4Q9UGU5 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
HMGXB4Q9UGU5 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
HMGXB4Q9UGU5 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
HMGXB4Q9UGU5 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
HMGXB4Q9UGU5 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
HMGXB4Q9UGU5 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
HMGXB4Q9UGU5 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
HMGXB4Q9UGU5 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
HMGXB4Q9UGU5 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
HMGXB4Q9UGU5 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
HMGXB4Q9UGU5 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
HMGXB4Q9UGU5 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
HMGXB4Q9UGU5 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
HMGXB4Q9UGU5 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
HMGXB4Q9UGU5 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
HMGXB4Q9UGU5 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
HMGXB4Q9UGU5 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
HMGXB4Q9UGU5 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
HMGXB4Q9UGU5 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
HMGXB4Q9UGU5 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
HMGXB4Q9UGU5 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
HMGXB4Q9UGU5 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
HMGXB4Q9UGU5 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
HMGXB4Q9UGU5 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
HMGXB4Q9UGU5 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
HMGXB4Q9UGU5 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
HMGXB4Q9UGU5 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
HMGXB4Q9UGU5 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
HMGXB4Q9UGU5 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
HMGXB4Q9UGU5 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
HMGXB4Q9UGU5 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
HMGXB4Q9UGU5 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
HMGXB4Q9UGU5 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
HMGXB4Q9UGU5 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
HMGXB4Q9UGU5 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
HMGXB4Q9UGU5 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
HMGXB4Q9UGU5 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
HMGXB4Q9UGU5 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
HMGXB4Q9UGU5 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
HMGXB4Q9UGU5 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
HMGXB4Q9UGU5 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
HMGXB4Q9UGU5 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
HMGXB4Q9UGU5 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
HMGXB4Q9UGU5 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
HMGXB4Q9UGU5 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
HMGXB4Q9UGU5 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
HMGXB4Q9UGU5 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
HMGXB4Q9UGU5 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
HMGXB4Q9UGU5 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
HMGXB4Q9UGU5 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
HMGXB4Q9UGU5 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
HMGXB4Q9UGU5 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
HMGXB4Q9UGU5 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
HMGXB4Q9UGU5 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
HMGXB4Q9UGU5 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
HMGXB4Q9UGU5 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
HMGXB4Q9UGU5 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
HMGXB4Q9UGU5 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
HMGXB4Q9UGU5 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
HMGXB4Q9UGU5 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
HMGXB4Q9UGU5 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
HMGXB4Q9UGU5 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
HMGXB4Q9UGU5 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
HMGXB4Q9UGU5 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
HMGXB4Q9UGU5 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
HMGXB4Q9UGU5 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
HMGXB4Q9UGU5 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
HMGXB4Q9UGU5 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
HMGXB4Q9UGU5 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
HMGXB4Q9UGU5 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
HMGXB4Q9UGU5 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
HMGXB4Q9UGU5 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
HMGXB4Q9UGU5 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
HMGXB4Q9UGU5 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
HMGXB4Q9UGU5 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
HMGXB4Q9UGU5 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
HMGXB4Q9UGU5 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
HMGXB4Q9UGU5 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
HMGXB4Q9UGU5 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms