Protein–RNA interactions for Protein: Q9UGL1

KDM5B, Lysine-specific demethylase 5B, humanhuman

Predictions only

Length 1,544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM5BQ9UGL1 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.8■■■■□ 3.16
KDM5BQ9UGL1 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC34.8■■■■□ 3.16
KDM5BQ9UGL1 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.8■■■■□ 3.16
KDM5BQ9UGL1 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.8■■■■□ 3.16
KDM5BQ9UGL1 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.79■■■■□ 3.16
KDM5BQ9UGL1 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC34.79■■■■□ 3.16
KDM5BQ9UGL1 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC34.79■■■■□ 3.16
KDM5BQ9UGL1 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.79■■■■□ 3.16
KDM5BQ9UGL1 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC34.79■■■■□ 3.16
KDM5BQ9UGL1 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC34.79■■■■□ 3.16
KDM5BQ9UGL1 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC34.79■■■■□ 3.16
KDM5BQ9UGL1 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC34.79■■■■□ 3.16
KDM5BQ9UGL1 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC34.79■■■■□ 3.16
KDM5BQ9UGL1 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC34.79■■■■□ 3.16
KDM5BQ9UGL1 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC34.78■■■■□ 3.16
KDM5BQ9UGL1 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC34.78■■■■□ 3.16
KDM5BQ9UGL1 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC34.78■■■■□ 3.16
KDM5BQ9UGL1 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC34.78■■■■□ 3.16
KDM5BQ9UGL1 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC34.77■■■■□ 3.16
KDM5BQ9UGL1 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC34.77■■■■□ 3.16
KDM5BQ9UGL1 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC34.77■■■■□ 3.16
KDM5BQ9UGL1 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC34.77■■■■□ 3.16
KDM5BQ9UGL1 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC34.77■■■■□ 3.16
KDM5BQ9UGL1 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.77■■■■□ 3.16
KDM5BQ9UGL1 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC34.77■■■■□ 3.16
KDM5BQ9UGL1 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.76■■■■□ 3.16
KDM5BQ9UGL1 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC34.76■■■■□ 3.16
KDM5BQ9UGL1 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC34.76■■■■□ 3.16
KDM5BQ9UGL1 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.76■■■■□ 3.16
KDM5BQ9UGL1 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC34.76■■■■□ 3.16
KDM5BQ9UGL1 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC34.76■■■■□ 3.15
KDM5BQ9UGL1 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC34.76■■■■□ 3.15
KDM5BQ9UGL1 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC34.76■■■■□ 3.15
KDM5BQ9UGL1 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC34.76■■■■□ 3.15
KDM5BQ9UGL1 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC34.76■■■■□ 3.15
KDM5BQ9UGL1 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC34.76■■■■□ 3.15
KDM5BQ9UGL1 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.75■■■■□ 3.15
KDM5BQ9UGL1 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.75■■■■□ 3.15
KDM5BQ9UGL1 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC34.75■■■■□ 3.15
KDM5BQ9UGL1 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.75■■■■□ 3.15
KDM5BQ9UGL1 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC34.75■■■■□ 3.15
KDM5BQ9UGL1 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC34.75■■■■□ 3.15
KDM5BQ9UGL1 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC34.74■■■■□ 3.15
KDM5BQ9UGL1 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC34.74■■■■□ 3.15
KDM5BQ9UGL1 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC34.74■■■■□ 3.15
KDM5BQ9UGL1 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.74■■■■□ 3.15
KDM5BQ9UGL1 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC34.74■■■■□ 3.15
KDM5BQ9UGL1 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC34.74■■■■□ 3.15
KDM5BQ9UGL1 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC34.74■■■■□ 3.15
KDM5BQ9UGL1 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.74■■■■□ 3.15
KDM5BQ9UGL1 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.74■■■■□ 3.15
KDM5BQ9UGL1 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC34.73■■■■□ 3.15
KDM5BQ9UGL1 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC34.73■■■■□ 3.15
KDM5BQ9UGL1 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.73■■■■□ 3.15
KDM5BQ9UGL1 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC34.73■■■■□ 3.15
KDM5BQ9UGL1 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC34.73■■■■□ 3.15
KDM5BQ9UGL1 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC34.73■■■■□ 3.15
KDM5BQ9UGL1 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC34.73■■■■□ 3.15
KDM5BQ9UGL1 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.72■■■■□ 3.15
KDM5BQ9UGL1 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.72■■■■□ 3.15
KDM5BQ9UGL1 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.72■■■■□ 3.15
KDM5BQ9UGL1 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC34.72■■■■□ 3.15
KDM5BQ9UGL1 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC34.72■■■■□ 3.15
KDM5BQ9UGL1 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.72■■■■□ 3.15
KDM5BQ9UGL1 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.72■■■■□ 3.15
KDM5BQ9UGL1 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
KDM5BQ9UGL1 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
KDM5BQ9UGL1 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC34.71■■■■□ 3.15
KDM5BQ9UGL1 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.15
KDM5BQ9UGL1 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.15
KDM5BQ9UGL1 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.15
KDM5BQ9UGL1 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.14
KDM5BQ9UGL1 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.14
KDM5BQ9UGL1 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC34.7■■■■□ 3.14
KDM5BQ9UGL1 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC34.7■■■■□ 3.14
KDM5BQ9UGL1 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC34.7■■■■□ 3.14
KDM5BQ9UGL1 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC34.7■■■■□ 3.14
KDM5BQ9UGL1 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.14
KDM5BQ9UGL1 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
KDM5BQ9UGL1 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC34.69■■■■□ 3.14
KDM5BQ9UGL1 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC34.69■■■■□ 3.14
KDM5BQ9UGL1 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC34.68■■■■□ 3.14
KDM5BQ9UGL1 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.68■■■■□ 3.14
KDM5BQ9UGL1 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.68■■■■□ 3.14
KDM5BQ9UGL1 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC34.68■■■■□ 3.14
KDM5BQ9UGL1 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.68■■■■□ 3.14
KDM5BQ9UGL1 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC34.68■■■■□ 3.14
KDM5BQ9UGL1 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC34.68■■■■□ 3.14
KDM5BQ9UGL1 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC34.68■■■■□ 3.14
KDM5BQ9UGL1 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.68■■■■□ 3.14
KDM5BQ9UGL1 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.68■■■■□ 3.14
KDM5BQ9UGL1 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
KDM5BQ9UGL1 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
KDM5BQ9UGL1 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC34.67■■■■□ 3.14
KDM5BQ9UGL1 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC34.66■■■■□ 3.14
KDM5BQ9UGL1 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC34.66■■■■□ 3.14
KDM5BQ9UGL1 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.66■■■■□ 3.14
KDM5BQ9UGL1 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC34.66■■■■□ 3.14
KDM5BQ9UGL1 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC34.66■■■■□ 3.14
KDM5BQ9UGL1 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.66■■■■□ 3.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms