Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2D1

CHD7, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 7, humanhuman

Predictions only

Length 2,997 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHD7Q9P2D1 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CHD7Q9P2D1 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CHD7Q9P2D1 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CHD7Q9P2D1 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CHD7Q9P2D1 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CHD7Q9P2D1 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CHD7Q9P2D1 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CHD7Q9P2D1 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CHD7Q9P2D1 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CHD7Q9P2D1 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CHD7Q9P2D1 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CHD7Q9P2D1 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
CHD7Q9P2D1 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CHD7Q9P2D1 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CHD7Q9P2D1 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CHD7Q9P2D1 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CHD7Q9P2D1 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CHD7Q9P2D1 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CHD7Q9P2D1 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.38
CHD7Q9P2D1 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC23.64■■□□□ 1.38
CHD7Q9P2D1 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.38
CHD7Q9P2D1 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CHD7Q9P2D1 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CHD7Q9P2D1 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
CHD7Q9P2D1 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
CHD7Q9P2D1 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
CHD7Q9P2D1 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
CHD7Q9P2D1 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CHD7Q9P2D1 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
CHD7Q9P2D1 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CHD7Q9P2D1 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CHD7Q9P2D1 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CHD7Q9P2D1 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CHD7Q9P2D1 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CHD7Q9P2D1 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CHD7Q9P2D1 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CHD7Q9P2D1 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CHD7Q9P2D1 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CHD7Q9P2D1 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CHD7Q9P2D1 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CHD7Q9P2D1 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CHD7Q9P2D1 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
CHD7Q9P2D1 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CHD7Q9P2D1 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CHD7Q9P2D1 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CHD7Q9P2D1 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CHD7Q9P2D1 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CHD7Q9P2D1 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CHD7Q9P2D1 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CHD7Q9P2D1 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CHD7Q9P2D1 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CHD7Q9P2D1 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CHD7Q9P2D1 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CHD7Q9P2D1 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CHD7Q9P2D1 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CHD7Q9P2D1 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CHD7Q9P2D1 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CHD7Q9P2D1 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CHD7Q9P2D1 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
CHD7Q9P2D1 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CHD7Q9P2D1 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CHD7Q9P2D1 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CHD7Q9P2D1 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CHD7Q9P2D1 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CHD7Q9P2D1 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CHD7Q9P2D1 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CHD7Q9P2D1 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CHD7Q9P2D1 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CHD7Q9P2D1 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CHD7Q9P2D1 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CHD7Q9P2D1 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CHD7Q9P2D1 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CHD7Q9P2D1 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CHD7Q9P2D1 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CHD7Q9P2D1 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CHD7Q9P2D1 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CHD7Q9P2D1 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CHD7Q9P2D1 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CHD7Q9P2D1 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CHD7Q9P2D1 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CHD7Q9P2D1 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CHD7Q9P2D1 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CHD7Q9P2D1 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CHD7Q9P2D1 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CHD7Q9P2D1 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CHD7Q9P2D1 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CHD7Q9P2D1 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CHD7Q9P2D1 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CHD7Q9P2D1 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CHD7Q9P2D1 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
CHD7Q9P2D1 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CHD7Q9P2D1 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CHD7Q9P2D1 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CHD7Q9P2D1 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CHD7Q9P2D1 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CHD7Q9P2D1 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CHD7Q9P2D1 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
CHD7Q9P2D1 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
CHD7Q9P2D1 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
CHD7Q9P2D1 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms