Protein–RNA interactions for Protein: Q9P1Z9

CCDC180, Coiled-coil domain-containing protein 180, humanhuman

Predictions only

Length 1,646 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC180Q9P1Z9 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.8■■■■■ 4.92
CCDC180Q9P1Z9 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC45.8■■■■■ 4.92
CCDC180Q9P1Z9 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC45.8■■■■■ 4.92
CCDC180Q9P1Z9 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC45.8■■■■■ 4.92
CCDC180Q9P1Z9 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC45.8■■■■■ 4.92
CCDC180Q9P1Z9 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC45.8■■■■■ 4.92
CCDC180Q9P1Z9 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC45.8■■■■■ 4.92
CCDC180Q9P1Z9 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC45.8■■■■■ 4.92
CCDC180Q9P1Z9 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.8■■■■■ 4.92
CCDC180Q9P1Z9 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC45.8■■■■■ 4.92
CCDC180Q9P1Z9 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC45.79■■■■■ 4.92
CCDC180Q9P1Z9 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC45.79■■■■■ 4.92
CCDC180Q9P1Z9 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.79■■■■■ 4.92
CCDC180Q9P1Z9 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.79■■■■■ 4.92
CCDC180Q9P1Z9 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC45.79■■■■■ 4.92
CCDC180Q9P1Z9 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC45.79■■■■■ 4.92
CCDC180Q9P1Z9 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC45.79■■■■■ 4.92
CCDC180Q9P1Z9 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.78■■■■■ 4.92
CCDC180Q9P1Z9 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC45.78■■■■■ 4.92
CCDC180Q9P1Z9 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC45.78■■■■■ 4.92
CCDC180Q9P1Z9 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.78■■■■■ 4.92
CCDC180Q9P1Z9 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC45.77■■■■■ 4.92
CCDC180Q9P1Z9 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.77■■■■■ 4.92
CCDC180Q9P1Z9 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.77■■■■■ 4.92
CCDC180Q9P1Z9 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC45.77■■■■■ 4.92
CCDC180Q9P1Z9 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC45.76■■■■■ 4.92
CCDC180Q9P1Z9 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC45.75■■■■■ 4.91
CCDC180Q9P1Z9 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.75■■■■■ 4.91
CCDC180Q9P1Z9 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC45.75■■■■■ 4.91
CCDC180Q9P1Z9 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.75■■■■■ 4.91
CCDC180Q9P1Z9 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC45.74■■■■■ 4.91
CCDC180Q9P1Z9 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC45.74■■■■■ 4.91
CCDC180Q9P1Z9 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC45.74■■■■■ 4.91
CCDC180Q9P1Z9 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC45.74■■■■■ 4.91
CCDC180Q9P1Z9 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC45.74■■■■■ 4.91
CCDC180Q9P1Z9 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC45.74■■■■■ 4.91
CCDC180Q9P1Z9 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC45.74■■■■■ 4.91
CCDC180Q9P1Z9 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC45.73■■■■■ 4.91
CCDC180Q9P1Z9 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC45.73■■■■■ 4.91
CCDC180Q9P1Z9 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC45.73■■■■■ 4.91
CCDC180Q9P1Z9 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC45.73■■■■■ 4.91
CCDC180Q9P1Z9 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC45.73■■■■■ 4.91
CCDC180Q9P1Z9 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC45.73■■■■■ 4.91
CCDC180Q9P1Z9 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.72■■■■■ 4.91
CCDC180Q9P1Z9 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC45.72■■■■■ 4.91
CCDC180Q9P1Z9 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC45.72■■■■■ 4.91
CCDC180Q9P1Z9 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC45.72■■■■■ 4.91
CCDC180Q9P1Z9 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC45.72■■■■■ 4.91
CCDC180Q9P1Z9 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC45.71■■■■■ 4.91
CCDC180Q9P1Z9 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC45.71■■■■■ 4.91
CCDC180Q9P1Z9 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC45.71■■■■■ 4.91
CCDC180Q9P1Z9 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC45.71■■■■■ 4.91
CCDC180Q9P1Z9 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC45.71■■■■■ 4.91
CCDC180Q9P1Z9 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC45.7■■■■■ 4.91
CCDC180Q9P1Z9 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC45.7■■■■■ 4.91
CCDC180Q9P1Z9 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC45.7■■■■■ 4.91
CCDC180Q9P1Z9 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC45.7■■■■■ 4.91
CCDC180Q9P1Z9 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC45.7■■■■■ 4.91
CCDC180Q9P1Z9 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC45.7■■■■■ 4.91
CCDC180Q9P1Z9 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC45.7■■■■■ 4.91
CCDC180Q9P1Z9 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC45.7■■■■■ 4.91
CCDC180Q9P1Z9 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC45.7■■■■■ 4.91
CCDC180Q9P1Z9 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC45.7■■■■■ 4.91
CCDC180Q9P1Z9 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.69■■■■■ 4.9
CCDC180Q9P1Z9 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC45.69■■■■■ 4.9
CCDC180Q9P1Z9 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC45.69■■■■■ 4.9
CCDC180Q9P1Z9 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC45.68■■■■■ 4.9
CCDC180Q9P1Z9 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC45.68■■■■■ 4.9
CCDC180Q9P1Z9 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC45.68■■■■■ 4.9
CCDC180Q9P1Z9 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC45.68■■■■■ 4.9
CCDC180Q9P1Z9 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC45.67■■■■■ 4.9
CCDC180Q9P1Z9 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.66■■■■■ 4.9
CCDC180Q9P1Z9 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC45.66■■■■■ 4.9
CCDC180Q9P1Z9 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC45.66■■■■■ 4.9
CCDC180Q9P1Z9 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC45.66■■■■■ 4.9
CCDC180Q9P1Z9 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC45.66■■■■■ 4.9
CCDC180Q9P1Z9 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC45.66■■■■■ 4.9
CCDC180Q9P1Z9 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC45.66■■■■■ 4.9
CCDC180Q9P1Z9 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC45.66■■■■■ 4.9
CCDC180Q9P1Z9 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC45.65■■■■■ 4.9
CCDC180Q9P1Z9 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC45.65■■■■■ 4.9
CCDC180Q9P1Z9 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.65■■■■■ 4.9
CCDC180Q9P1Z9 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC45.65■■■■■ 4.9
CCDC180Q9P1Z9 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC45.65■■■■■ 4.9
CCDC180Q9P1Z9 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC45.64■■■■■ 4.9
CCDC180Q9P1Z9 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC45.64■■■■■ 4.9
CCDC180Q9P1Z9 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC45.64■■■■■ 4.9
CCDC180Q9P1Z9 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC45.64■■■■■ 4.9
CCDC180Q9P1Z9 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC45.64■■■■■ 4.9
CCDC180Q9P1Z9 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC45.63■■■■■ 4.9
CCDC180Q9P1Z9 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC45.63■■■■■ 4.9
CCDC180Q9P1Z9 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC45.63■■■■■ 4.9
CCDC180Q9P1Z9 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC45.63■■■■■ 4.9
CCDC180Q9P1Z9 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC45.63■■■■■ 4.89
CCDC180Q9P1Z9 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC45.63■■■■■ 4.89
CCDC180Q9P1Z9 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC45.63■■■■■ 4.89
CCDC180Q9P1Z9 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC45.62■■■■■ 4.89
CCDC180Q9P1Z9 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC45.62■■■■■ 4.89
CCDC180Q9P1Z9 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC45.62■■■■■ 4.89
CCDC180Q9P1Z9 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC45.62■■■■■ 4.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.9 ms