Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX09

DDIT4, DNA damage-inducible transcript 4 protein, humanhuman

Predictions only

Length 232 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDIT4Q9NX09 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
DDIT4Q9NX09 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
DDIT4Q9NX09 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
DDIT4Q9NX09 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
DDIT4Q9NX09 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
DDIT4Q9NX09 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
DDIT4Q9NX09 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
DDIT4Q9NX09 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
DDIT4Q9NX09 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
DDIT4Q9NX09 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
DDIT4Q9NX09 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
DDIT4Q9NX09 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
DDIT4Q9NX09 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
DDIT4Q9NX09 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
DDIT4Q9NX09 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
DDIT4Q9NX09 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
DDIT4Q9NX09 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
DDIT4Q9NX09 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
DDIT4Q9NX09 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
DDIT4Q9NX09 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
DDIT4Q9NX09 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
DDIT4Q9NX09 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
DDIT4Q9NX09 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
DDIT4Q9NX09 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
DDIT4Q9NX09 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
DDIT4Q9NX09 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
DDIT4Q9NX09 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
DDIT4Q9NX09 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
DDIT4Q9NX09 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
DDIT4Q9NX09 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
DDIT4Q9NX09 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC22.89■■□□□ 1.25
DDIT4Q9NX09 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
DDIT4Q9NX09 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
DDIT4Q9NX09 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
DDIT4Q9NX09 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
DDIT4Q9NX09 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
DDIT4Q9NX09 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
DDIT4Q9NX09 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
DDIT4Q9NX09 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
DDIT4Q9NX09 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
DDIT4Q9NX09 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
DDIT4Q9NX09 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
DDIT4Q9NX09 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
DDIT4Q9NX09 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
DDIT4Q9NX09 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
DDIT4Q9NX09 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
DDIT4Q9NX09 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
DDIT4Q9NX09 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
DDIT4Q9NX09 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
DDIT4Q9NX09 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
DDIT4Q9NX09 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
DDIT4Q9NX09 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
DDIT4Q9NX09 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
DDIT4Q9NX09 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
DDIT4Q9NX09 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
DDIT4Q9NX09 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
DDIT4Q9NX09 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
DDIT4Q9NX09 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
DDIT4Q9NX09 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
DDIT4Q9NX09 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
DDIT4Q9NX09 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
DDIT4Q9NX09 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
DDIT4Q9NX09 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
DDIT4Q9NX09 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
DDIT4Q9NX09 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
DDIT4Q9NX09 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
DDIT4Q9NX09 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
DDIT4Q9NX09 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
DDIT4Q9NX09 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
DDIT4Q9NX09 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
DDIT4Q9NX09 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
DDIT4Q9NX09 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
DDIT4Q9NX09 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
DDIT4Q9NX09 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
DDIT4Q9NX09 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
DDIT4Q9NX09 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
DDIT4Q9NX09 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
DDIT4Q9NX09 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
DDIT4Q9NX09 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
DDIT4Q9NX09 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
DDIT4Q9NX09 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
DDIT4Q9NX09 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
DDIT4Q9NX09 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
DDIT4Q9NX09 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
DDIT4Q9NX09 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
DDIT4Q9NX09 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
DDIT4Q9NX09 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
DDIT4Q9NX09 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
DDIT4Q9NX09 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
DDIT4Q9NX09 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
DDIT4Q9NX09 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
DDIT4Q9NX09 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
DDIT4Q9NX09 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
DDIT4Q9NX09 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
DDIT4Q9NX09 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
DDIT4Q9NX09 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
DDIT4Q9NX09 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
DDIT4Q9NX09 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
DDIT4Q9NX09 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
DDIT4Q9NX09 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.4 ms