Protein–RNA interactions for Protein: Q9NTX7

RNF146, E3 ubiquitin-protein ligase RNF146, humanhuman

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Length 359 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF146Q9NTX7 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
RNF146Q9NTX7 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
RNF146Q9NTX7 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
RNF146Q9NTX7 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
RNF146Q9NTX7 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
RNF146Q9NTX7 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
RNF146Q9NTX7 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
RNF146Q9NTX7 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
RNF146Q9NTX7 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
RNF146Q9NTX7 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
RNF146Q9NTX7 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
RNF146Q9NTX7 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
RNF146Q9NTX7 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
RNF146Q9NTX7 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.62
RNF146Q9NTX7 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
RNF146Q9NTX7 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
RNF146Q9NTX7 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
RNF146Q9NTX7 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
RNF146Q9NTX7 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
RNF146Q9NTX7 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
RNF146Q9NTX7 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
RNF146Q9NTX7 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
RNF146Q9NTX7 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RNF146Q9NTX7 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
RNF146Q9NTX7 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
RNF146Q9NTX7 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC25.19■■□□□ 1.62
RNF146Q9NTX7 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
RNF146Q9NTX7 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
RNF146Q9NTX7 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
RNF146Q9NTX7 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
RNF146Q9NTX7 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
RNF146Q9NTX7 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
RNF146Q9NTX7 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
RNF146Q9NTX7 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
RNF146Q9NTX7 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RNF146Q9NTX7 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RNF146Q9NTX7 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
RNF146Q9NTX7 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
RNF146Q9NTX7 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
RNF146Q9NTX7 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
RNF146Q9NTX7 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
RNF146Q9NTX7 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
RNF146Q9NTX7 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
RNF146Q9NTX7 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
RNF146Q9NTX7 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
RNF146Q9NTX7 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
RNF146Q9NTX7 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
RNF146Q9NTX7 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
RNF146Q9NTX7 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
RNF146Q9NTX7 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
RNF146Q9NTX7 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
RNF146Q9NTX7 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
RNF146Q9NTX7 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
RNF146Q9NTX7 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
RNF146Q9NTX7 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
RNF146Q9NTX7 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
RNF146Q9NTX7 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
RNF146Q9NTX7 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
RNF146Q9NTX7 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
RNF146Q9NTX7 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
RNF146Q9NTX7 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
RNF146Q9NTX7 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
RNF146Q9NTX7 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
RNF146Q9NTX7 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
RNF146Q9NTX7 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
RNF146Q9NTX7 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
RNF146Q9NTX7 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
RNF146Q9NTX7 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
RNF146Q9NTX7 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
RNF146Q9NTX7 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
RNF146Q9NTX7 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
RNF146Q9NTX7 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
RNF146Q9NTX7 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
RNF146Q9NTX7 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
RNF146Q9NTX7 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
RNF146Q9NTX7 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
RNF146Q9NTX7 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
RNF146Q9NTX7 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
RNF146Q9NTX7 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
RNF146Q9NTX7 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
RNF146Q9NTX7 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
RNF146Q9NTX7 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
RNF146Q9NTX7 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
RNF146Q9NTX7 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.61
RNF146Q9NTX7 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
RNF146Q9NTX7 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
RNF146Q9NTX7 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
RNF146Q9NTX7 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
RNF146Q9NTX7 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
RNF146Q9NTX7 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
RNF146Q9NTX7 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
RNF146Q9NTX7 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
RNF146Q9NTX7 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
RNF146Q9NTX7 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
RNF146Q9NTX7 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
RNF146Q9NTX7 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
RNF146Q9NTX7 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
RNF146Q9NTX7 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
RNF146Q9NTX7 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
RNF146Q9NTX7 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC25.12■■□□□ 1.61
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