Protein–RNA interactions for Protein: Q9NS15

LTBP3, Latent-transforming growth factor beta-binding protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,303 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTBP3Q9NS15 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
LTBP3Q9NS15 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
LTBP3Q9NS15 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
LTBP3Q9NS15 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
LTBP3Q9NS15 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
LTBP3Q9NS15 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
LTBP3Q9NS15 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
LTBP3Q9NS15 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
LTBP3Q9NS15 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
LTBP3Q9NS15 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
LTBP3Q9NS15 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
LTBP3Q9NS15 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
LTBP3Q9NS15 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
LTBP3Q9NS15 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
LTBP3Q9NS15 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
LTBP3Q9NS15 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
LTBP3Q9NS15 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC26.95■■□□□ 1.91
LTBP3Q9NS15 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
LTBP3Q9NS15 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
LTBP3Q9NS15 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
LTBP3Q9NS15 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.91
LTBP3Q9NS15 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.91
LTBP3Q9NS15 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC26.95■■□□□ 1.91
LTBP3Q9NS15 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.91
LTBP3Q9NS15 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
LTBP3Q9NS15 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC26.95■■□□□ 1.91
LTBP3Q9NS15 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
LTBP3Q9NS15 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
LTBP3Q9NS15 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
LTBP3Q9NS15 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
LTBP3Q9NS15 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
LTBP3Q9NS15 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
LTBP3Q9NS15 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
LTBP3Q9NS15 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
LTBP3Q9NS15 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
LTBP3Q9NS15 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
LTBP3Q9NS15 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC26.93■■□□□ 1.9
LTBP3Q9NS15 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
LTBP3Q9NS15 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
LTBP3Q9NS15 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC26.93■■□□□ 1.9
LTBP3Q9NS15 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
LTBP3Q9NS15 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
LTBP3Q9NS15 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
LTBP3Q9NS15 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
LTBP3Q9NS15 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC26.92■■□□□ 1.9
LTBP3Q9NS15 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
LTBP3Q9NS15 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
LTBP3Q9NS15 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
LTBP3Q9NS15 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
LTBP3Q9NS15 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
LTBP3Q9NS15 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
LTBP3Q9NS15 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
LTBP3Q9NS15 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
LTBP3Q9NS15 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
LTBP3Q9NS15 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
LTBP3Q9NS15 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
LTBP3Q9NS15 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
LTBP3Q9NS15 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
LTBP3Q9NS15 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
LTBP3Q9NS15 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
LTBP3Q9NS15 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
LTBP3Q9NS15 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
LTBP3Q9NS15 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
LTBP3Q9NS15 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
LTBP3Q9NS15 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
LTBP3Q9NS15 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
LTBP3Q9NS15 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
LTBP3Q9NS15 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
LTBP3Q9NS15 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
LTBP3Q9NS15 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
LTBP3Q9NS15 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
LTBP3Q9NS15 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
LTBP3Q9NS15 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
LTBP3Q9NS15 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
LTBP3Q9NS15 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
LTBP3Q9NS15 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
LTBP3Q9NS15 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
LTBP3Q9NS15 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
LTBP3Q9NS15 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.89
LTBP3Q9NS15 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.89
LTBP3Q9NS15 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC26.89■■□□□ 1.89
LTBP3Q9NS15 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
LTBP3Q9NS15 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
LTBP3Q9NS15 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
LTBP3Q9NS15 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
LTBP3Q9NS15 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
LTBP3Q9NS15 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
LTBP3Q9NS15 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
LTBP3Q9NS15 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
LTBP3Q9NS15 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
LTBP3Q9NS15 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
LTBP3Q9NS15 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
LTBP3Q9NS15 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
LTBP3Q9NS15 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
LTBP3Q9NS15 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
LTBP3Q9NS15 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
LTBP3Q9NS15 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
LTBP3Q9NS15 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
LTBP3Q9NS15 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
LTBP3Q9NS15 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.8 ms