Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRG0

CHRAC1, Chromatin accessibility complex protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 131 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRAC1Q9NRG0 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CHRAC1Q9NRG0 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
CHRAC1Q9NRG0 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CHRAC1Q9NRG0 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CHRAC1Q9NRG0 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CHRAC1Q9NRG0 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CHRAC1Q9NRG0 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CHRAC1Q9NRG0 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CHRAC1Q9NRG0 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CHRAC1Q9NRG0 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CHRAC1Q9NRG0 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CHRAC1Q9NRG0 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CHRAC1Q9NRG0 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CHRAC1Q9NRG0 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CHRAC1Q9NRG0 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CHRAC1Q9NRG0 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CHRAC1Q9NRG0 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
CHRAC1Q9NRG0 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CHRAC1Q9NRG0 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
CHRAC1Q9NRG0 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
CHRAC1Q9NRG0 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
CHRAC1Q9NRG0 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CHRAC1Q9NRG0 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CHRAC1Q9NRG0 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CHRAC1Q9NRG0 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CHRAC1Q9NRG0 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CHRAC1Q9NRG0 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CHRAC1Q9NRG0 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CHRAC1Q9NRG0 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CHRAC1Q9NRG0 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CHRAC1Q9NRG0 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CHRAC1Q9NRG0 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CHRAC1Q9NRG0 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CHRAC1Q9NRG0 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CHRAC1Q9NRG0 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CHRAC1Q9NRG0 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CHRAC1Q9NRG0 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CHRAC1Q9NRG0 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CHRAC1Q9NRG0 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CHRAC1Q9NRG0 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CHRAC1Q9NRG0 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CHRAC1Q9NRG0 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CHRAC1Q9NRG0 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CHRAC1Q9NRG0 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CHRAC1Q9NRG0 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CHRAC1Q9NRG0 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CHRAC1Q9NRG0 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CHRAC1Q9NRG0 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CHRAC1Q9NRG0 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CHRAC1Q9NRG0 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CHRAC1Q9NRG0 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CHRAC1Q9NRG0 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CHRAC1Q9NRG0 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
CHRAC1Q9NRG0 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
CHRAC1Q9NRG0 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CHRAC1Q9NRG0 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CHRAC1Q9NRG0 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CHRAC1Q9NRG0 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CHRAC1Q9NRG0 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CHRAC1Q9NRG0 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CHRAC1Q9NRG0 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CHRAC1Q9NRG0 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CHRAC1Q9NRG0 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CHRAC1Q9NRG0 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CHRAC1Q9NRG0 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CHRAC1Q9NRG0 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CHRAC1Q9NRG0 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CHRAC1Q9NRG0 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CHRAC1Q9NRG0 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CHRAC1Q9NRG0 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CHRAC1Q9NRG0 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CHRAC1Q9NRG0 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CHRAC1Q9NRG0 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CHRAC1Q9NRG0 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CHRAC1Q9NRG0 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CHRAC1Q9NRG0 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CHRAC1Q9NRG0 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CHRAC1Q9NRG0 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CHRAC1Q9NRG0 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CHRAC1Q9NRG0 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CHRAC1Q9NRG0 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CHRAC1Q9NRG0 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CHRAC1Q9NRG0 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CHRAC1Q9NRG0 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CHRAC1Q9NRG0 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CHRAC1Q9NRG0 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CHRAC1Q9NRG0 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CHRAC1Q9NRG0 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
CHRAC1Q9NRG0 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CHRAC1Q9NRG0 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
CHRAC1Q9NRG0 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CHRAC1Q9NRG0 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
CHRAC1Q9NRG0 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CHRAC1Q9NRG0 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CHRAC1Q9NRG0 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CHRAC1Q9NRG0 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CHRAC1Q9NRG0 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
CHRAC1Q9NRG0 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CHRAC1Q9NRG0 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CHRAC1Q9NRG0 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms