Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRA0

SPHK2, Sphingosine kinase 2, humanhuman

Predictions only

Length 654 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPHK2Q9NRA0 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
SPHK2Q9NRA0 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SPHK2Q9NRA0 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SPHK2Q9NRA0 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SPHK2Q9NRA0 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SPHK2Q9NRA0 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SPHK2Q9NRA0 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SPHK2Q9NRA0 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SPHK2Q9NRA0 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SPHK2Q9NRA0 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SPHK2Q9NRA0 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
SPHK2Q9NRA0 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SPHK2Q9NRA0 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
SPHK2Q9NRA0 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
SPHK2Q9NRA0 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
SPHK2Q9NRA0 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
SPHK2Q9NRA0 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
SPHK2Q9NRA0 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
SPHK2Q9NRA0 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
SPHK2Q9NRA0 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SPHK2Q9NRA0 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SPHK2Q9NRA0 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SPHK2Q9NRA0 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SPHK2Q9NRA0 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SPHK2Q9NRA0 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SPHK2Q9NRA0 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SPHK2Q9NRA0 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SPHK2Q9NRA0 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SPHK2Q9NRA0 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SPHK2Q9NRA0 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SPHK2Q9NRA0 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SPHK2Q9NRA0 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SPHK2Q9NRA0 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SPHK2Q9NRA0 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SPHK2Q9NRA0 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SPHK2Q9NRA0 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SPHK2Q9NRA0 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SPHK2Q9NRA0 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SPHK2Q9NRA0 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SPHK2Q9NRA0 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SPHK2Q9NRA0 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SPHK2Q9NRA0 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SPHK2Q9NRA0 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SPHK2Q9NRA0 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SPHK2Q9NRA0 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SPHK2Q9NRA0 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SPHK2Q9NRA0 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SPHK2Q9NRA0 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SPHK2Q9NRA0 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SPHK2Q9NRA0 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SPHK2Q9NRA0 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SPHK2Q9NRA0 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
SPHK2Q9NRA0 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SPHK2Q9NRA0 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SPHK2Q9NRA0 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SPHK2Q9NRA0 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SPHK2Q9NRA0 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SPHK2Q9NRA0 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SPHK2Q9NRA0 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SPHK2Q9NRA0 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SPHK2Q9NRA0 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SPHK2Q9NRA0 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SPHK2Q9NRA0 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
SPHK2Q9NRA0 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SPHK2Q9NRA0 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SPHK2Q9NRA0 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SPHK2Q9NRA0 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SPHK2Q9NRA0 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SPHK2Q9NRA0 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SPHK2Q9NRA0 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SPHK2Q9NRA0 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
SPHK2Q9NRA0 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SPHK2Q9NRA0 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SPHK2Q9NRA0 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SPHK2Q9NRA0 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SPHK2Q9NRA0 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SPHK2Q9NRA0 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SPHK2Q9NRA0 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SPHK2Q9NRA0 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SPHK2Q9NRA0 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SPHK2Q9NRA0 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SPHK2Q9NRA0 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SPHK2Q9NRA0 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SPHK2Q9NRA0 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SPHK2Q9NRA0 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SPHK2Q9NRA0 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SPHK2Q9NRA0 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SPHK2Q9NRA0 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SPHK2Q9NRA0 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SPHK2Q9NRA0 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SPHK2Q9NRA0 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SPHK2Q9NRA0 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SPHK2Q9NRA0 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SPHK2Q9NRA0 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SPHK2Q9NRA0 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
SPHK2Q9NRA0 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SPHK2Q9NRA0 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SPHK2Q9NRA0 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SPHK2Q9NRA0 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SPHK2Q9NRA0 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms