Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPR2

SEMA4B, Semaphorin-4B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 832 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA4BQ9NPR2 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SEMA4BQ9NPR2 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SEMA4BQ9NPR2 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SEMA4BQ9NPR2 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SEMA4BQ9NPR2 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SEMA4BQ9NPR2 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SEMA4BQ9NPR2 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SEMA4BQ9NPR2 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SEMA4BQ9NPR2 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SEMA4BQ9NPR2 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
SEMA4BQ9NPR2 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SEMA4BQ9NPR2 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SEMA4BQ9NPR2 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SEMA4BQ9NPR2 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SEMA4BQ9NPR2 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SEMA4BQ9NPR2 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SEMA4BQ9NPR2 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SEMA4BQ9NPR2 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SEMA4BQ9NPR2 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SEMA4BQ9NPR2 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SEMA4BQ9NPR2 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SEMA4BQ9NPR2 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SEMA4BQ9NPR2 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SEMA4BQ9NPR2 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
SEMA4BQ9NPR2 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SEMA4BQ9NPR2 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SEMA4BQ9NPR2 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SEMA4BQ9NPR2 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SEMA4BQ9NPR2 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SEMA4BQ9NPR2 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
SEMA4BQ9NPR2 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SEMA4BQ9NPR2 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SEMA4BQ9NPR2 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SEMA4BQ9NPR2 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SEMA4BQ9NPR2 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SEMA4BQ9NPR2 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SEMA4BQ9NPR2 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
SEMA4BQ9NPR2 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SEMA4BQ9NPR2 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.03
SEMA4BQ9NPR2 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SEMA4BQ9NPR2 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SEMA4BQ9NPR2 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SEMA4BQ9NPR2 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SEMA4BQ9NPR2 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SEMA4BQ9NPR2 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SEMA4BQ9NPR2 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SEMA4BQ9NPR2 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SEMA4BQ9NPR2 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SEMA4BQ9NPR2 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SEMA4BQ9NPR2 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
SEMA4BQ9NPR2 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SEMA4BQ9NPR2 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SEMA4BQ9NPR2 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SEMA4BQ9NPR2 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SEMA4BQ9NPR2 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SEMA4BQ9NPR2 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SEMA4BQ9NPR2 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
SEMA4BQ9NPR2 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SEMA4BQ9NPR2 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SEMA4BQ9NPR2 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
SEMA4BQ9NPR2 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SEMA4BQ9NPR2 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SEMA4BQ9NPR2 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SEMA4BQ9NPR2 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SEMA4BQ9NPR2 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SEMA4BQ9NPR2 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SEMA4BQ9NPR2 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SEMA4BQ9NPR2 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SEMA4BQ9NPR2 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SEMA4BQ9NPR2 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SEMA4BQ9NPR2 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SEMA4BQ9NPR2 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SEMA4BQ9NPR2 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SEMA4BQ9NPR2 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
SEMA4BQ9NPR2 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SEMA4BQ9NPR2 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SEMA4BQ9NPR2 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SEMA4BQ9NPR2 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SEMA4BQ9NPR2 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SEMA4BQ9NPR2 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SEMA4BQ9NPR2 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SEMA4BQ9NPR2 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SEMA4BQ9NPR2 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SEMA4BQ9NPR2 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SEMA4BQ9NPR2 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SEMA4BQ9NPR2 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SEMA4BQ9NPR2 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SEMA4BQ9NPR2 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SEMA4BQ9NPR2 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
SEMA4BQ9NPR2 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SEMA4BQ9NPR2 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SEMA4BQ9NPR2 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SEMA4BQ9NPR2 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SEMA4BQ9NPR2 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SEMA4BQ9NPR2 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SEMA4BQ9NPR2 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SEMA4BQ9NPR2 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SEMA4BQ9NPR2 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SEMA4BQ9NPR2 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SEMA4BQ9NPR2 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.8 ms