Protein–RNA interactions for Protein: Q9HBI1

PARVB, Beta-parvin, humanhuman

Predictions only

Length 364 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PARVBQ9HBI1 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PARVBQ9HBI1 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
PARVBQ9HBI1 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PARVBQ9HBI1 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PARVBQ9HBI1 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PARVBQ9HBI1 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PARVBQ9HBI1 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
PARVBQ9HBI1 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
PARVBQ9HBI1 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PARVBQ9HBI1 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PARVBQ9HBI1 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PARVBQ9HBI1 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
PARVBQ9HBI1 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PARVBQ9HBI1 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PARVBQ9HBI1 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PARVBQ9HBI1 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PARVBQ9HBI1 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PARVBQ9HBI1 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PARVBQ9HBI1 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PARVBQ9HBI1 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PARVBQ9HBI1 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PARVBQ9HBI1 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
PARVBQ9HBI1 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PARVBQ9HBI1 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PARVBQ9HBI1 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PARVBQ9HBI1 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PARVBQ9HBI1 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PARVBQ9HBI1 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PARVBQ9HBI1 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PARVBQ9HBI1 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PARVBQ9HBI1 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PARVBQ9HBI1 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
PARVBQ9HBI1 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PARVBQ9HBI1 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PARVBQ9HBI1 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PARVBQ9HBI1 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PARVBQ9HBI1 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
PARVBQ9HBI1 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PARVBQ9HBI1 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PARVBQ9HBI1 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PARVBQ9HBI1 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PARVBQ9HBI1 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PARVBQ9HBI1 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PARVBQ9HBI1 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PARVBQ9HBI1 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PARVBQ9HBI1 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PARVBQ9HBI1 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PARVBQ9HBI1 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
PARVBQ9HBI1 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
PARVBQ9HBI1 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PARVBQ9HBI1 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
PARVBQ9HBI1 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
PARVBQ9HBI1 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PARVBQ9HBI1 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PARVBQ9HBI1 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PARVBQ9HBI1 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PARVBQ9HBI1 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PARVBQ9HBI1 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PARVBQ9HBI1 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PARVBQ9HBI1 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PARVBQ9HBI1 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PARVBQ9HBI1 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PARVBQ9HBI1 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PARVBQ9HBI1 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PARVBQ9HBI1 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PARVBQ9HBI1 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PARVBQ9HBI1 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PARVBQ9HBI1 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PARVBQ9HBI1 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PARVBQ9HBI1 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PARVBQ9HBI1 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PARVBQ9HBI1 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PARVBQ9HBI1 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PARVBQ9HBI1 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PARVBQ9HBI1 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PARVBQ9HBI1 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PARVBQ9HBI1 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PARVBQ9HBI1 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PARVBQ9HBI1 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PARVBQ9HBI1 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PARVBQ9HBI1 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
PARVBQ9HBI1 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PARVBQ9HBI1 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PARVBQ9HBI1 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PARVBQ9HBI1 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PARVBQ9HBI1 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PARVBQ9HBI1 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
PARVBQ9HBI1 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PARVBQ9HBI1 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PARVBQ9HBI1 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
PARVBQ9HBI1 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PARVBQ9HBI1 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PARVBQ9HBI1 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PARVBQ9HBI1 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PARVBQ9HBI1 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PARVBQ9HBI1 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PARVBQ9HBI1 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PARVBQ9HBI1 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PARVBQ9HBI1 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PARVBQ9HBI1 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms