Protein–RNA interactions for Protein: Q9H8K7

C10orf88, Uncharacterized protein C10orf88, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C10orf88Q9H8K7 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
C10orf88Q9H8K7 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
C10orf88Q9H8K7 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
C10orf88Q9H8K7 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
C10orf88Q9H8K7 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
C10orf88Q9H8K7 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
C10orf88Q9H8K7 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
C10orf88Q9H8K7 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
C10orf88Q9H8K7 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
C10orf88Q9H8K7 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
C10orf88Q9H8K7 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
C10orf88Q9H8K7 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
C10orf88Q9H8K7 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
C10orf88Q9H8K7 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
C10orf88Q9H8K7 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
C10orf88Q9H8K7 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
C10orf88Q9H8K7 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
C10orf88Q9H8K7 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
C10orf88Q9H8K7 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
C10orf88Q9H8K7 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
C10orf88Q9H8K7 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
C10orf88Q9H8K7 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
C10orf88Q9H8K7 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
C10orf88Q9H8K7 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
C10orf88Q9H8K7 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
C10orf88Q9H8K7 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
C10orf88Q9H8K7 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
C10orf88Q9H8K7 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
C10orf88Q9H8K7 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
C10orf88Q9H8K7 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
C10orf88Q9H8K7 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
C10orf88Q9H8K7 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
C10orf88Q9H8K7 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
C10orf88Q9H8K7 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
C10orf88Q9H8K7 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
C10orf88Q9H8K7 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
C10orf88Q9H8K7 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
C10orf88Q9H8K7 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
C10orf88Q9H8K7 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
C10orf88Q9H8K7 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
C10orf88Q9H8K7 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
C10orf88Q9H8K7 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
C10orf88Q9H8K7 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
C10orf88Q9H8K7 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
C10orf88Q9H8K7 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
C10orf88Q9H8K7 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
C10orf88Q9H8K7 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
C10orf88Q9H8K7 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
C10orf88Q9H8K7 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
C10orf88Q9H8K7 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
C10orf88Q9H8K7 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
C10orf88Q9H8K7 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
C10orf88Q9H8K7 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
C10orf88Q9H8K7 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
C10orf88Q9H8K7 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
C10orf88Q9H8K7 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
C10orf88Q9H8K7 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
C10orf88Q9H8K7 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
C10orf88Q9H8K7 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
C10orf88Q9H8K7 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
C10orf88Q9H8K7 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
C10orf88Q9H8K7 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
C10orf88Q9H8K7 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
C10orf88Q9H8K7 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
C10orf88Q9H8K7 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
C10orf88Q9H8K7 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
C10orf88Q9H8K7 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
C10orf88Q9H8K7 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
C10orf88Q9H8K7 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
C10orf88Q9H8K7 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
C10orf88Q9H8K7 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
C10orf88Q9H8K7 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
C10orf88Q9H8K7 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
C10orf88Q9H8K7 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
C10orf88Q9H8K7 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
C10orf88Q9H8K7 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
C10orf88Q9H8K7 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
C10orf88Q9H8K7 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
C10orf88Q9H8K7 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
C10orf88Q9H8K7 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
C10orf88Q9H8K7 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
C10orf88Q9H8K7 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
C10orf88Q9H8K7 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
C10orf88Q9H8K7 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
C10orf88Q9H8K7 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
C10orf88Q9H8K7 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
C10orf88Q9H8K7 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
C10orf88Q9H8K7 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
C10orf88Q9H8K7 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
C10orf88Q9H8K7 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
C10orf88Q9H8K7 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
C10orf88Q9H8K7 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
C10orf88Q9H8K7 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
C10orf88Q9H8K7 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
C10orf88Q9H8K7 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
C10orf88Q9H8K7 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
C10orf88Q9H8K7 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
C10orf88Q9H8K7 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
C10orf88Q9H8K7 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
C10orf88Q9H8K7 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms