Protein–RNA interactions for Protein: Q9H7B4

SMYD3, Histone-lysine N-methyltransferase SMYD3, humanhuman

Predictions only

Length 428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMYD3Q9H7B4 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SMYD3Q9H7B4 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SMYD3Q9H7B4 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
SMYD3Q9H7B4 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SMYD3Q9H7B4 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SMYD3Q9H7B4 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
SMYD3Q9H7B4 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
SMYD3Q9H7B4 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
SMYD3Q9H7B4 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SMYD3Q9H7B4 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SMYD3Q9H7B4 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SMYD3Q9H7B4 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SMYD3Q9H7B4 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SMYD3Q9H7B4 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
SMYD3Q9H7B4 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SMYD3Q9H7B4 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
SMYD3Q9H7B4 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SMYD3Q9H7B4 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SMYD3Q9H7B4 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SMYD3Q9H7B4 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SMYD3Q9H7B4 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SMYD3Q9H7B4 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SMYD3Q9H7B4 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SMYD3Q9H7B4 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SMYD3Q9H7B4 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
SMYD3Q9H7B4 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SMYD3Q9H7B4 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SMYD3Q9H7B4 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SMYD3Q9H7B4 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SMYD3Q9H7B4 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SMYD3Q9H7B4 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SMYD3Q9H7B4 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SMYD3Q9H7B4 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SMYD3Q9H7B4 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SMYD3Q9H7B4 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SMYD3Q9H7B4 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SMYD3Q9H7B4 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SMYD3Q9H7B4 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SMYD3Q9H7B4 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SMYD3Q9H7B4 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SMYD3Q9H7B4 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SMYD3Q9H7B4 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SMYD3Q9H7B4 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
SMYD3Q9H7B4 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SMYD3Q9H7B4 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SMYD3Q9H7B4 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SMYD3Q9H7B4 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SMYD3Q9H7B4 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SMYD3Q9H7B4 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SMYD3Q9H7B4 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SMYD3Q9H7B4 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SMYD3Q9H7B4 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SMYD3Q9H7B4 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SMYD3Q9H7B4 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SMYD3Q9H7B4 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
SMYD3Q9H7B4 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SMYD3Q9H7B4 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SMYD3Q9H7B4 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SMYD3Q9H7B4 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SMYD3Q9H7B4 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SMYD3Q9H7B4 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SMYD3Q9H7B4 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SMYD3Q9H7B4 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SMYD3Q9H7B4 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SMYD3Q9H7B4 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SMYD3Q9H7B4 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SMYD3Q9H7B4 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SMYD3Q9H7B4 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SMYD3Q9H7B4 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SMYD3Q9H7B4 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SMYD3Q9H7B4 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
SMYD3Q9H7B4 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SMYD3Q9H7B4 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SMYD3Q9H7B4 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SMYD3Q9H7B4 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SMYD3Q9H7B4 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SMYD3Q9H7B4 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SMYD3Q9H7B4 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SMYD3Q9H7B4 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
SMYD3Q9H7B4 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SMYD3Q9H7B4 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SMYD3Q9H7B4 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SMYD3Q9H7B4 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SMYD3Q9H7B4 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SMYD3Q9H7B4 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SMYD3Q9H7B4 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SMYD3Q9H7B4 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
SMYD3Q9H7B4 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SMYD3Q9H7B4 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SMYD3Q9H7B4 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SMYD3Q9H7B4 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SMYD3Q9H7B4 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SMYD3Q9H7B4 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SMYD3Q9H7B4 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SMYD3Q9H7B4 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SMYD3Q9H7B4 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SMYD3Q9H7B4 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SMYD3Q9H7B4 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SMYD3Q9H7B4 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SMYD3Q9H7B4 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.4 ms