Protein–RNA interactions for Protein: Q9H790

EXO5, Exonuclease V, humanhuman

Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXO5Q9H790 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
EXO5Q9H790 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
EXO5Q9H790 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
EXO5Q9H790 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
EXO5Q9H790 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
EXO5Q9H790 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
EXO5Q9H790 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
EXO5Q9H790 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
EXO5Q9H790 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
EXO5Q9H790 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
EXO5Q9H790 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
EXO5Q9H790 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
EXO5Q9H790 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
EXO5Q9H790 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
EXO5Q9H790 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
EXO5Q9H790 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
EXO5Q9H790 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
EXO5Q9H790 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
EXO5Q9H790 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
EXO5Q9H790 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
EXO5Q9H790 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
EXO5Q9H790 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
EXO5Q9H790 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
EXO5Q9H790 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
EXO5Q9H790 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
EXO5Q9H790 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
EXO5Q9H790 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
EXO5Q9H790 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
EXO5Q9H790 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
EXO5Q9H790 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
EXO5Q9H790 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
EXO5Q9H790 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
EXO5Q9H790 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
EXO5Q9H790 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
EXO5Q9H790 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
EXO5Q9H790 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
EXO5Q9H790 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
EXO5Q9H790 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
EXO5Q9H790 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
EXO5Q9H790 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
EXO5Q9H790 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
EXO5Q9H790 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
EXO5Q9H790 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
EXO5Q9H790 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
EXO5Q9H790 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
EXO5Q9H790 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
EXO5Q9H790 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
EXO5Q9H790 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
EXO5Q9H790 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
EXO5Q9H790 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
EXO5Q9H790 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
EXO5Q9H790 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
EXO5Q9H790 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
EXO5Q9H790 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
EXO5Q9H790 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
EXO5Q9H790 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
EXO5Q9H790 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
EXO5Q9H790 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
EXO5Q9H790 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
EXO5Q9H790 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
EXO5Q9H790 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
EXO5Q9H790 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
EXO5Q9H790 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
EXO5Q9H790 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
EXO5Q9H790 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
EXO5Q9H790 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
EXO5Q9H790 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
EXO5Q9H790 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
EXO5Q9H790 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
EXO5Q9H790 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
EXO5Q9H790 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
EXO5Q9H790 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
EXO5Q9H790 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
EXO5Q9H790 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
EXO5Q9H790 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
EXO5Q9H790 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
EXO5Q9H790 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
EXO5Q9H790 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
EXO5Q9H790 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
EXO5Q9H790 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
EXO5Q9H790 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
EXO5Q9H790 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
EXO5Q9H790 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
EXO5Q9H790 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
EXO5Q9H790 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
EXO5Q9H790 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
EXO5Q9H790 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
EXO5Q9H790 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
EXO5Q9H790 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
EXO5Q9H790 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
EXO5Q9H790 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
EXO5Q9H790 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
EXO5Q9H790 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
EXO5Q9H790 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
EXO5Q9H790 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
EXO5Q9H790 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
EXO5Q9H790 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
EXO5Q9H790 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
EXO5Q9H790 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
EXO5Q9H790 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.3 ms