Protein–RNA interactions for Protein: Q9H422

HIPK3, Homeodomain-interacting protein kinase 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIPK3Q9H422 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
HIPK3Q9H422 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
HIPK3Q9H422 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
HIPK3Q9H422 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
HIPK3Q9H422 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
HIPK3Q9H422 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
HIPK3Q9H422 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
HIPK3Q9H422 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
HIPK3Q9H422 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
HIPK3Q9H422 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
HIPK3Q9H422 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
HIPK3Q9H422 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC24.24■■□□□ 1.47
HIPK3Q9H422 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
HIPK3Q9H422 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
HIPK3Q9H422 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
HIPK3Q9H422 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
HIPK3Q9H422 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
HIPK3Q9H422 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
HIPK3Q9H422 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
HIPK3Q9H422 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
HIPK3Q9H422 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
HIPK3Q9H422 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
HIPK3Q9H422 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
HIPK3Q9H422 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
HIPK3Q9H422 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
HIPK3Q9H422 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
HIPK3Q9H422 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
HIPK3Q9H422 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
HIPK3Q9H422 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
HIPK3Q9H422 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
HIPK3Q9H422 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
HIPK3Q9H422 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
HIPK3Q9H422 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
HIPK3Q9H422 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
HIPK3Q9H422 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
HIPK3Q9H422 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
HIPK3Q9H422 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
HIPK3Q9H422 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
HIPK3Q9H422 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
HIPK3Q9H422 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
HIPK3Q9H422 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
HIPK3Q9H422 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
HIPK3Q9H422 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
HIPK3Q9H422 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
HIPK3Q9H422 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
HIPK3Q9H422 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
HIPK3Q9H422 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC24.21■■□□□ 1.47
HIPK3Q9H422 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
HIPK3Q9H422 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
HIPK3Q9H422 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
HIPK3Q9H422 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
HIPK3Q9H422 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
HIPK3Q9H422 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
HIPK3Q9H422 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
HIPK3Q9H422 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
HIPK3Q9H422 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
HIPK3Q9H422 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
HIPK3Q9H422 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
HIPK3Q9H422 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
HIPK3Q9H422 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
HIPK3Q9H422 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
HIPK3Q9H422 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
HIPK3Q9H422 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
HIPK3Q9H422 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
HIPK3Q9H422 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
HIPK3Q9H422 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
HIPK3Q9H422 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
HIPK3Q9H422 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
HIPK3Q9H422 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
HIPK3Q9H422 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
HIPK3Q9H422 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
HIPK3Q9H422 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
HIPK3Q9H422 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
HIPK3Q9H422 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
HIPK3Q9H422 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
HIPK3Q9H422 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
HIPK3Q9H422 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
HIPK3Q9H422 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
HIPK3Q9H422 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
HIPK3Q9H422 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
HIPK3Q9H422 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
HIPK3Q9H422 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
HIPK3Q9H422 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
HIPK3Q9H422 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
HIPK3Q9H422 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
HIPK3Q9H422 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
HIPK3Q9H422 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
HIPK3Q9H422 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
HIPK3Q9H422 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
HIPK3Q9H422 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
HIPK3Q9H422 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
HIPK3Q9H422 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
HIPK3Q9H422 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
HIPK3Q9H422 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
HIPK3Q9H422 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
HIPK3Q9H422 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
HIPK3Q9H422 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
HIPK3Q9H422 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
HIPK3Q9H422 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
HIPK3Q9H422 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms