Protein–RNA interactions for Protein: Q9H0F6

SHARPIN, Sharpin, humanhuman

Predictions only

Length 387 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHARPINQ9H0F6 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SHARPINQ9H0F6 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SHARPINQ9H0F6 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SHARPINQ9H0F6 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SHARPINQ9H0F6 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SHARPINQ9H0F6 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SHARPINQ9H0F6 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
SHARPINQ9H0F6 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
SHARPINQ9H0F6 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SHARPINQ9H0F6 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SHARPINQ9H0F6 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SHARPINQ9H0F6 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SHARPINQ9H0F6 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SHARPINQ9H0F6 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SHARPINQ9H0F6 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SHARPINQ9H0F6 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SHARPINQ9H0F6 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SHARPINQ9H0F6 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SHARPINQ9H0F6 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SHARPINQ9H0F6 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SHARPINQ9H0F6 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SHARPINQ9H0F6 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SHARPINQ9H0F6 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SHARPINQ9H0F6 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SHARPINQ9H0F6 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SHARPINQ9H0F6 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
SHARPINQ9H0F6 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SHARPINQ9H0F6 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SHARPINQ9H0F6 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SHARPINQ9H0F6 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SHARPINQ9H0F6 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SHARPINQ9H0F6 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
SHARPINQ9H0F6 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SHARPINQ9H0F6 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SHARPINQ9H0F6 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SHARPINQ9H0F6 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
SHARPINQ9H0F6 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
SHARPINQ9H0F6 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
SHARPINQ9H0F6 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.65
SHARPINQ9H0F6 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
SHARPINQ9H0F6 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
SHARPINQ9H0F6 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SHARPINQ9H0F6 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SHARPINQ9H0F6 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SHARPINQ9H0F6 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SHARPINQ9H0F6 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SHARPINQ9H0F6 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SHARPINQ9H0F6 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SHARPINQ9H0F6 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SHARPINQ9H0F6 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SHARPINQ9H0F6 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SHARPINQ9H0F6 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SHARPINQ9H0F6 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SHARPINQ9H0F6 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SHARPINQ9H0F6 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SHARPINQ9H0F6 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SHARPINQ9H0F6 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SHARPINQ9H0F6 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SHARPINQ9H0F6 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SHARPINQ9H0F6 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
SHARPINQ9H0F6 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SHARPINQ9H0F6 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
SHARPINQ9H0F6 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SHARPINQ9H0F6 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SHARPINQ9H0F6 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SHARPINQ9H0F6 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SHARPINQ9H0F6 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
SHARPINQ9H0F6 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SHARPINQ9H0F6 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SHARPINQ9H0F6 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SHARPINQ9H0F6 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SHARPINQ9H0F6 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SHARPINQ9H0F6 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SHARPINQ9H0F6 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SHARPINQ9H0F6 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SHARPINQ9H0F6 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SHARPINQ9H0F6 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SHARPINQ9H0F6 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SHARPINQ9H0F6 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SHARPINQ9H0F6 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SHARPINQ9H0F6 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SHARPINQ9H0F6 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SHARPINQ9H0F6 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SHARPINQ9H0F6 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SHARPINQ9H0F6 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SHARPINQ9H0F6 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SHARPINQ9H0F6 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SHARPINQ9H0F6 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SHARPINQ9H0F6 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
SHARPINQ9H0F6 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SHARPINQ9H0F6 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SHARPINQ9H0F6 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SHARPINQ9H0F6 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SHARPINQ9H0F6 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
SHARPINQ9H0F6 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SHARPINQ9H0F6 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SHARPINQ9H0F6 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SHARPINQ9H0F6 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SHARPINQ9H0F6 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SHARPINQ9H0F6 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.2 ms