Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZU5

NYX, Nyctalopin, humanhuman

Predictions only

Length 481 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NYXQ9GZU5 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
NYXQ9GZU5 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
NYXQ9GZU5 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
NYXQ9GZU5 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
NYXQ9GZU5 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
NYXQ9GZU5 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
NYXQ9GZU5 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
NYXQ9GZU5 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
NYXQ9GZU5 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
NYXQ9GZU5 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
NYXQ9GZU5 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
NYXQ9GZU5 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC27.58■■■□□ 2.01
NYXQ9GZU5 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
NYXQ9GZU5 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
NYXQ9GZU5 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
NYXQ9GZU5 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
NYXQ9GZU5 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
NYXQ9GZU5 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
NYXQ9GZU5 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
NYXQ9GZU5 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
NYXQ9GZU5 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
NYXQ9GZU5 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
NYXQ9GZU5 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
NYXQ9GZU5 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
NYXQ9GZU5 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
NYXQ9GZU5 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
NYXQ9GZU5 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
NYXQ9GZU5 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
NYXQ9GZU5 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC27.57■■■□□ 2
NYXQ9GZU5 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
NYXQ9GZU5 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
NYXQ9GZU5 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
NYXQ9GZU5 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
NYXQ9GZU5 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC27.56■■■□□ 2
NYXQ9GZU5 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
NYXQ9GZU5 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC27.56■■■□□ 2
NYXQ9GZU5 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
NYXQ9GZU5 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
NYXQ9GZU5 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
NYXQ9GZU5 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
NYXQ9GZU5 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
NYXQ9GZU5 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
NYXQ9GZU5 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
NYXQ9GZU5 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
NYXQ9GZU5 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
NYXQ9GZU5 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
NYXQ9GZU5 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
NYXQ9GZU5 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
NYXQ9GZU5 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC27.55■■■□□ 2
NYXQ9GZU5 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
NYXQ9GZU5 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
NYXQ9GZU5 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
NYXQ9GZU5 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
NYXQ9GZU5 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
NYXQ9GZU5 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
NYXQ9GZU5 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC27.53■■■□□ 2
NYXQ9GZU5 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
NYXQ9GZU5 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
NYXQ9GZU5 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
NYXQ9GZU5 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
NYXQ9GZU5 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
NYXQ9GZU5 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
NYXQ9GZU5 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
NYXQ9GZU5 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
NYXQ9GZU5 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
NYXQ9GZU5 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
NYXQ9GZU5 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC27.52■■■□□ 2
NYXQ9GZU5 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
NYXQ9GZU5 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
NYXQ9GZU5 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
NYXQ9GZU5 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
NYXQ9GZU5 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
NYXQ9GZU5 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC27.52■■■□□ 2
NYXQ9GZU5 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
NYXQ9GZU5 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
NYXQ9GZU5 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
NYXQ9GZU5 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
NYXQ9GZU5 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
NYXQ9GZU5 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
NYXQ9GZU5 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
NYXQ9GZU5 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
NYXQ9GZU5 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
NYXQ9GZU5 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
NYXQ9GZU5 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
NYXQ9GZU5 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
NYXQ9GZU5 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
NYXQ9GZU5 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
NYXQ9GZU5 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
NYXQ9GZU5 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
NYXQ9GZU5 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
NYXQ9GZU5 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
NYXQ9GZU5 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
NYXQ9GZU5 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC27.49■■□□□ 1.99
NYXQ9GZU5 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
NYXQ9GZU5 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
NYXQ9GZU5 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
NYXQ9GZU5 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
NYXQ9GZU5 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
NYXQ9GZU5 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
NYXQ9GZU5 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms