Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZT8

NIF3L1, NIF3-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIF3L1Q9GZT8 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NIF3L1Q9GZT8 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NIF3L1Q9GZT8 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NIF3L1Q9GZT8 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NIF3L1Q9GZT8 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NIF3L1Q9GZT8 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
NIF3L1Q9GZT8 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
NIF3L1Q9GZT8 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
NIF3L1Q9GZT8 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
NIF3L1Q9GZT8 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
NIF3L1Q9GZT8 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
NIF3L1Q9GZT8 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
NIF3L1Q9GZT8 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
NIF3L1Q9GZT8 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
NIF3L1Q9GZT8 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC23.55■■□□□ 1.36
NIF3L1Q9GZT8 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
NIF3L1Q9GZT8 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
NIF3L1Q9GZT8 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
NIF3L1Q9GZT8 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
NIF3L1Q9GZT8 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
NIF3L1Q9GZT8 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
NIF3L1Q9GZT8 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
NIF3L1Q9GZT8 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NIF3L1Q9GZT8 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
NIF3L1Q9GZT8 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
NIF3L1Q9GZT8 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
NIF3L1Q9GZT8 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
NIF3L1Q9GZT8 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
NIF3L1Q9GZT8 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
NIF3L1Q9GZT8 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NIF3L1Q9GZT8 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NIF3L1Q9GZT8 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NIF3L1Q9GZT8 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NIF3L1Q9GZT8 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NIF3L1Q9GZT8 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
NIF3L1Q9GZT8 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NIF3L1Q9GZT8 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
NIF3L1Q9GZT8 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
NIF3L1Q9GZT8 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NIF3L1Q9GZT8 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NIF3L1Q9GZT8 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
NIF3L1Q9GZT8 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NIF3L1Q9GZT8 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NIF3L1Q9GZT8 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
NIF3L1Q9GZT8 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
NIF3L1Q9GZT8 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
NIF3L1Q9GZT8 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
NIF3L1Q9GZT8 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
NIF3L1Q9GZT8 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
NIF3L1Q9GZT8 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NIF3L1Q9GZT8 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NIF3L1Q9GZT8 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
NIF3L1Q9GZT8 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NIF3L1Q9GZT8 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
NIF3L1Q9GZT8 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.35
NIF3L1Q9GZT8 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
NIF3L1Q9GZT8 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NIF3L1Q9GZT8 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NIF3L1Q9GZT8 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
NIF3L1Q9GZT8 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NIF3L1Q9GZT8 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
NIF3L1Q9GZT8 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NIF3L1Q9GZT8 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
NIF3L1Q9GZT8 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
NIF3L1Q9GZT8 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
NIF3L1Q9GZT8 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
NIF3L1Q9GZT8 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
NIF3L1Q9GZT8 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
NIF3L1Q9GZT8 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
NIF3L1Q9GZT8 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
NIF3L1Q9GZT8 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NIF3L1Q9GZT8 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
NIF3L1Q9GZT8 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
NIF3L1Q9GZT8 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
NIF3L1Q9GZT8 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
NIF3L1Q9GZT8 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NIF3L1Q9GZT8 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NIF3L1Q9GZT8 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
NIF3L1Q9GZT8 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NIF3L1Q9GZT8 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NIF3L1Q9GZT8 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NIF3L1Q9GZT8 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NIF3L1Q9GZT8 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
NIF3L1Q9GZT8 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
NIF3L1Q9GZT8 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
NIF3L1Q9GZT8 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
NIF3L1Q9GZT8 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NIF3L1Q9GZT8 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NIF3L1Q9GZT8 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NIF3L1Q9GZT8 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NIF3L1Q9GZT8 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
NIF3L1Q9GZT8 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NIF3L1Q9GZT8 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
NIF3L1Q9GZT8 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NIF3L1Q9GZT8 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NIF3L1Q9GZT8 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NIF3L1Q9GZT8 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NIF3L1Q9GZT8 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
NIF3L1Q9GZT8 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
NIF3L1Q9GZT8 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.5 ms