Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZM5

YIPF3, Protein YIPF3, humanhuman

Predictions only

Length 350 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
YIPF3Q9GZM5 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
YIPF3Q9GZM5 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
YIPF3Q9GZM5 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC20.85■□□□□ 0.93
YIPF3Q9GZM5 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
YIPF3Q9GZM5 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
YIPF3Q9GZM5 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
YIPF3Q9GZM5 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
YIPF3Q9GZM5 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
YIPF3Q9GZM5 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
YIPF3Q9GZM5 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
YIPF3Q9GZM5 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
YIPF3Q9GZM5 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
YIPF3Q9GZM5 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
YIPF3Q9GZM5 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
YIPF3Q9GZM5 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
YIPF3Q9GZM5 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
YIPF3Q9GZM5 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
YIPF3Q9GZM5 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
YIPF3Q9GZM5 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
YIPF3Q9GZM5 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
YIPF3Q9GZM5 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
YIPF3Q9GZM5 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
YIPF3Q9GZM5 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
YIPF3Q9GZM5 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
YIPF3Q9GZM5 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
YIPF3Q9GZM5 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
YIPF3Q9GZM5 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
YIPF3Q9GZM5 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
YIPF3Q9GZM5 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
YIPF3Q9GZM5 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
YIPF3Q9GZM5 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
YIPF3Q9GZM5 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
YIPF3Q9GZM5 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC20.82■□□□□ 0.92
YIPF3Q9GZM5 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
YIPF3Q9GZM5 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
YIPF3Q9GZM5 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
YIPF3Q9GZM5 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
YIPF3Q9GZM5 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
YIPF3Q9GZM5 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
YIPF3Q9GZM5 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
YIPF3Q9GZM5 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
YIPF3Q9GZM5 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
YIPF3Q9GZM5 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
YIPF3Q9GZM5 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
YIPF3Q9GZM5 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
YIPF3Q9GZM5 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
YIPF3Q9GZM5 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
YIPF3Q9GZM5 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
YIPF3Q9GZM5 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.81■□□□□ 0.92
YIPF3Q9GZM5 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
YIPF3Q9GZM5 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
YIPF3Q9GZM5 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
YIPF3Q9GZM5 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
YIPF3Q9GZM5 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC20.81■□□□□ 0.92
YIPF3Q9GZM5 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
YIPF3Q9GZM5 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
YIPF3Q9GZM5 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
YIPF3Q9GZM5 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
YIPF3Q9GZM5 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
YIPF3Q9GZM5 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
YIPF3Q9GZM5 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
YIPF3Q9GZM5 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
YIPF3Q9GZM5 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
YIPF3Q9GZM5 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
YIPF3Q9GZM5 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC20.79■□□□□ 0.92
YIPF3Q9GZM5 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
YIPF3Q9GZM5 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
YIPF3Q9GZM5 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
YIPF3Q9GZM5 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
YIPF3Q9GZM5 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
YIPF3Q9GZM5 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
YIPF3Q9GZM5 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
YIPF3Q9GZM5 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
YIPF3Q9GZM5 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
YIPF3Q9GZM5 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
YIPF3Q9GZM5 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
YIPF3Q9GZM5 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
YIPF3Q9GZM5 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
YIPF3Q9GZM5 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
YIPF3Q9GZM5 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
YIPF3Q9GZM5 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
YIPF3Q9GZM5 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
YIPF3Q9GZM5 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
YIPF3Q9GZM5 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
YIPF3Q9GZM5 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
YIPF3Q9GZM5 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
YIPF3Q9GZM5 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
YIPF3Q9GZM5 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
YIPF3Q9GZM5 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
YIPF3Q9GZM5 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
YIPF3Q9GZM5 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
YIPF3Q9GZM5 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
YIPF3Q9GZM5 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
YIPF3Q9GZM5 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
YIPF3Q9GZM5 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
YIPF3Q9GZM5 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
YIPF3Q9GZM5 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
YIPF3Q9GZM5 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
YIPF3Q9GZM5 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
YIPF3Q9GZM5 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.4 ms