Protein–RNA interactions for Protein: Q9C009

FOXQ1, Forkhead box protein Q1, humanhuman

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Length 403 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXQ1Q9C009 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
FOXQ1Q9C009 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
FOXQ1Q9C009 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
FOXQ1Q9C009 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
FOXQ1Q9C009 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
FOXQ1Q9C009 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
FOXQ1Q9C009 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
FOXQ1Q9C009 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
FOXQ1Q9C009 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
FOXQ1Q9C009 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
FOXQ1Q9C009 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
FOXQ1Q9C009 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
FOXQ1Q9C009 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
FOXQ1Q9C009 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC22.41■■□□□ 1.18
FOXQ1Q9C009 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
FOXQ1Q9C009 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
FOXQ1Q9C009 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
FOXQ1Q9C009 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
FOXQ1Q9C009 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
FOXQ1Q9C009 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
FOXQ1Q9C009 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
FOXQ1Q9C009 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
FOXQ1Q9C009 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
FOXQ1Q9C009 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
FOXQ1Q9C009 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
FOXQ1Q9C009 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
FOXQ1Q9C009 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
FOXQ1Q9C009 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
FOXQ1Q9C009 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
FOXQ1Q9C009 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
FOXQ1Q9C009 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
FOXQ1Q9C009 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
FOXQ1Q9C009 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
FOXQ1Q9C009 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
FOXQ1Q9C009 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
FOXQ1Q9C009 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
FOXQ1Q9C009 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
FOXQ1Q9C009 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
FOXQ1Q9C009 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
FOXQ1Q9C009 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
FOXQ1Q9C009 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
FOXQ1Q9C009 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
FOXQ1Q9C009 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
FOXQ1Q9C009 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
FOXQ1Q9C009 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
FOXQ1Q9C009 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
FOXQ1Q9C009 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
FOXQ1Q9C009 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
FOXQ1Q9C009 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
FOXQ1Q9C009 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
FOXQ1Q9C009 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
FOXQ1Q9C009 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
FOXQ1Q9C009 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
FOXQ1Q9C009 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
FOXQ1Q9C009 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
FOXQ1Q9C009 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
FOXQ1Q9C009 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
FOXQ1Q9C009 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
FOXQ1Q9C009 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
FOXQ1Q9C009 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
FOXQ1Q9C009 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
FOXQ1Q9C009 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
FOXQ1Q9C009 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
FOXQ1Q9C009 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
FOXQ1Q9C009 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
FOXQ1Q9C009 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
FOXQ1Q9C009 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
FOXQ1Q9C009 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
FOXQ1Q9C009 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
FOXQ1Q9C009 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
FOXQ1Q9C009 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
FOXQ1Q9C009 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
FOXQ1Q9C009 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
FOXQ1Q9C009 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
FOXQ1Q9C009 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
FOXQ1Q9C009 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
FOXQ1Q9C009 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
FOXQ1Q9C009 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
FOXQ1Q9C009 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
FOXQ1Q9C009 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
FOXQ1Q9C009 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
FOXQ1Q9C009 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
FOXQ1Q9C009 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
FOXQ1Q9C009 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
FOXQ1Q9C009 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
FOXQ1Q9C009 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
FOXQ1Q9C009 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
FOXQ1Q9C009 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
FOXQ1Q9C009 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
FOXQ1Q9C009 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
FOXQ1Q9C009 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
FOXQ1Q9C009 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
FOXQ1Q9C009 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
FOXQ1Q9C009 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
FOXQ1Q9C009 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
FOXQ1Q9C009 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
FOXQ1Q9C009 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
FOXQ1Q9C009 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
FOXQ1Q9C009 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC22.33■■□□□ 1.17
FOXQ1Q9C009 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC22.33■■□□□ 1.17
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