Protein–RNA interactions for Protein: Q9C000

NLRP1, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLRP1Q9C000 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC32.08■■■□□ 2.73
NLRP1Q9C000 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC32.08■■■□□ 2.73
NLRP1Q9C000 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC32.08■■■□□ 2.73
NLRP1Q9C000 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC32.08■■■□□ 2.73
NLRP1Q9C000 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
NLRP1Q9C000 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC32.08■■■□□ 2.73
NLRP1Q9C000 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC32.08■■■□□ 2.73
NLRP1Q9C000 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC32.08■■■□□ 2.73
NLRP1Q9C000 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC32.08■■■□□ 2.73
NLRP1Q9C000 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
NLRP1Q9C000 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
NLRP1Q9C000 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
NLRP1Q9C000 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
NLRP1Q9C000 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
NLRP1Q9C000 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC32.07■■■□□ 2.72
NLRP1Q9C000 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC32.07■■■□□ 2.72
NLRP1Q9C000 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
NLRP1Q9C000 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
NLRP1Q9C000 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
NLRP1Q9C000 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC32.06■■■□□ 2.72
NLRP1Q9C000 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC32.06■■■□□ 2.72
NLRP1Q9C000 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
NLRP1Q9C000 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC32.06■■■□□ 2.72
NLRP1Q9C000 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC32.06■■■□□ 2.72
NLRP1Q9C000 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC32.06■■■□□ 2.72
NLRP1Q9C000 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
NLRP1Q9C000 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
NLRP1Q9C000 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC32.06■■■□□ 2.72
NLRP1Q9C000 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC32.05■■■□□ 2.72
NLRP1Q9C000 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC32.05■■■□□ 2.72
NLRP1Q9C000 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
NLRP1Q9C000 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
NLRP1Q9C000 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.05■■■□□ 2.72
NLRP1Q9C000 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
NLRP1Q9C000 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
NLRP1Q9C000 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
NLRP1Q9C000 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
NLRP1Q9C000 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
NLRP1Q9C000 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
NLRP1Q9C000 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC32.04■■■□□ 2.72
NLRP1Q9C000 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
NLRP1Q9C000 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
NLRP1Q9C000 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
NLRP1Q9C000 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC32.03■■■□□ 2.72
NLRP1Q9C000 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC32.03■■■□□ 2.72
NLRP1Q9C000 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC32.03■■■□□ 2.72
NLRP1Q9C000 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
NLRP1Q9C000 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
NLRP1Q9C000 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
NLRP1Q9C000 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC32.03■■■□□ 2.72
NLRP1Q9C000 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.02■■■□□ 2.72
NLRP1Q9C000 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
NLRP1Q9C000 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.02■■■□□ 2.72
NLRP1Q9C000 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.72
NLRP1Q9C000 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.71
NLRP1Q9C000 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.71
NLRP1Q9C000 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC32.01■■■□□ 2.71
NLRP1Q9C000 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC32.01■■■□□ 2.71
NLRP1Q9C000 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC32.01■■■□□ 2.71
NLRP1Q9C000 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC32.01■■■□□ 2.71
NLRP1Q9C000 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
NLRP1Q9C000 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC32■■■□□ 2.71
NLRP1Q9C000 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC31.99■■■□□ 2.71
NLRP1Q9C000 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.99■■■□□ 2.71
NLRP1Q9C000 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC31.99■■■□□ 2.71
NLRP1Q9C000 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.99■■■□□ 2.71
NLRP1Q9C000 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.99■■■□□ 2.71
NLRP1Q9C000 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC31.99■■■□□ 2.71
NLRP1Q9C000 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC31.99■■■□□ 2.71
NLRP1Q9C000 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
NLRP1Q9C000 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
NLRP1Q9C000 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
NLRP1Q9C000 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
NLRP1Q9C000 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
NLRP1Q9C000 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC31.97■■■□□ 2.71
NLRP1Q9C000 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
NLRP1Q9C000 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
NLRP1Q9C000 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
NLRP1Q9C000 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
NLRP1Q9C000 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC31.97■■■□□ 2.71
NLRP1Q9C000 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.97■■■□□ 2.71
NLRP1Q9C000 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
NLRP1Q9C000 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.96■■■□□ 2.71
NLRP1Q9C000 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
NLRP1Q9C000 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC31.96■■■□□ 2.71
NLRP1Q9C000 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
NLRP1Q9C000 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC31.96■■■□□ 2.71
NLRP1Q9C000 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC31.96■■■□□ 2.71
NLRP1Q9C000 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.96■■■□□ 2.71
NLRP1Q9C000 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC31.96■■■□□ 2.71
NLRP1Q9C000 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC31.95■■■□□ 2.71
NLRP1Q9C000 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC31.95■■■□□ 2.71
NLRP1Q9C000 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.71
NLRP1Q9C000 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.71
NLRP1Q9C000 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.7
NLRP1Q9C000 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC31.95■■■□□ 2.7
NLRP1Q9C000 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC31.95■■■□□ 2.7
NLRP1Q9C000 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC31.95■■■□□ 2.7
NLRP1Q9C000 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC31.95■■■□□ 2.7
NLRP1Q9C000 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC31.95■■■□□ 2.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms