Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYG3

NIFK, MKI67 FHA domain-interacting nucleolar phosphoprotein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 293 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIFKQ9BYG3 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NIFKQ9BYG3 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NIFKQ9BYG3 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
NIFKQ9BYG3 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC24.38■■□□□ 1.49
NIFKQ9BYG3 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
NIFKQ9BYG3 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
NIFKQ9BYG3 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
NIFKQ9BYG3 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NIFKQ9BYG3 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NIFKQ9BYG3 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
NIFKQ9BYG3 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
NIFKQ9BYG3 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NIFKQ9BYG3 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
NIFKQ9BYG3 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NIFKQ9BYG3 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
NIFKQ9BYG3 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
NIFKQ9BYG3 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
NIFKQ9BYG3 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NIFKQ9BYG3 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NIFKQ9BYG3 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC24.37■■□□□ 1.49
NIFKQ9BYG3 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NIFKQ9BYG3 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NIFKQ9BYG3 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
NIFKQ9BYG3 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
NIFKQ9BYG3 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
NIFKQ9BYG3 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
NIFKQ9BYG3 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
NIFKQ9BYG3 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
NIFKQ9BYG3 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
NIFKQ9BYG3 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
NIFKQ9BYG3 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
NIFKQ9BYG3 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
NIFKQ9BYG3 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
NIFKQ9BYG3 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NIFKQ9BYG3 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
NIFKQ9BYG3 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NIFKQ9BYG3 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NIFKQ9BYG3 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
NIFKQ9BYG3 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
NIFKQ9BYG3 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
NIFKQ9BYG3 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
NIFKQ9BYG3 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
NIFKQ9BYG3 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
NIFKQ9BYG3 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
NIFKQ9BYG3 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
NIFKQ9BYG3 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NIFKQ9BYG3 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NIFKQ9BYG3 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
NIFKQ9BYG3 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
NIFKQ9BYG3 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
NIFKQ9BYG3 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
NIFKQ9BYG3 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
NIFKQ9BYG3 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NIFKQ9BYG3 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NIFKQ9BYG3 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NIFKQ9BYG3 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
NIFKQ9BYG3 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
NIFKQ9BYG3 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
NIFKQ9BYG3 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
NIFKQ9BYG3 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
NIFKQ9BYG3 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
NIFKQ9BYG3 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
NIFKQ9BYG3 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
NIFKQ9BYG3 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
NIFKQ9BYG3 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
NIFKQ9BYG3 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
NIFKQ9BYG3 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
NIFKQ9BYG3 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NIFKQ9BYG3 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NIFKQ9BYG3 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NIFKQ9BYG3 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NIFKQ9BYG3 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
NIFKQ9BYG3 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
NIFKQ9BYG3 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NIFKQ9BYG3 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
NIFKQ9BYG3 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NIFKQ9BYG3 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
NIFKQ9BYG3 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NIFKQ9BYG3 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NIFKQ9BYG3 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
NIFKQ9BYG3 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NIFKQ9BYG3 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
NIFKQ9BYG3 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NIFKQ9BYG3 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NIFKQ9BYG3 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
NIFKQ9BYG3 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NIFKQ9BYG3 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NIFKQ9BYG3 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NIFKQ9BYG3 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
NIFKQ9BYG3 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NIFKQ9BYG3 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
NIFKQ9BYG3 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
NIFKQ9BYG3 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
NIFKQ9BYG3 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NIFKQ9BYG3 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NIFKQ9BYG3 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
NIFKQ9BYG3 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NIFKQ9BYG3 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NIFKQ9BYG3 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NIFKQ9BYG3 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms