Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY41

HDAC8, Histone deacetylase 8, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC8Q9BY41 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
HDAC8Q9BY41 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
HDAC8Q9BY41 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
HDAC8Q9BY41 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
HDAC8Q9BY41 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
HDAC8Q9BY41 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC21.99■■□□□ 1.11
HDAC8Q9BY41 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
HDAC8Q9BY41 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
HDAC8Q9BY41 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
HDAC8Q9BY41 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
HDAC8Q9BY41 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
HDAC8Q9BY41 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
HDAC8Q9BY41 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
HDAC8Q9BY41 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
HDAC8Q9BY41 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
HDAC8Q9BY41 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
HDAC8Q9BY41 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
HDAC8Q9BY41 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC21.98■■□□□ 1.11
HDAC8Q9BY41 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC21.98■■□□□ 1.11
HDAC8Q9BY41 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
HDAC8Q9BY41 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
HDAC8Q9BY41 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
HDAC8Q9BY41 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
HDAC8Q9BY41 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
HDAC8Q9BY41 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
HDAC8Q9BY41 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
HDAC8Q9BY41 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
HDAC8Q9BY41 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
HDAC8Q9BY41 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
HDAC8Q9BY41 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
HDAC8Q9BY41 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
HDAC8Q9BY41 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
HDAC8Q9BY41 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
HDAC8Q9BY41 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
HDAC8Q9BY41 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
HDAC8Q9BY41 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
HDAC8Q9BY41 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
HDAC8Q9BY41 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
HDAC8Q9BY41 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
HDAC8Q9BY41 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
HDAC8Q9BY41 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
HDAC8Q9BY41 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
HDAC8Q9BY41 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
HDAC8Q9BY41 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
HDAC8Q9BY41 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
HDAC8Q9BY41 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
HDAC8Q9BY41 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
HDAC8Q9BY41 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
HDAC8Q9BY41 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
HDAC8Q9BY41 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
HDAC8Q9BY41 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
HDAC8Q9BY41 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
HDAC8Q9BY41 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
HDAC8Q9BY41 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
HDAC8Q9BY41 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
HDAC8Q9BY41 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
HDAC8Q9BY41 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
HDAC8Q9BY41 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
HDAC8Q9BY41 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
HDAC8Q9BY41 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
HDAC8Q9BY41 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
HDAC8Q9BY41 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
HDAC8Q9BY41 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
HDAC8Q9BY41 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
HDAC8Q9BY41 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
HDAC8Q9BY41 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
HDAC8Q9BY41 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
HDAC8Q9BY41 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
HDAC8Q9BY41 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
HDAC8Q9BY41 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
HDAC8Q9BY41 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
HDAC8Q9BY41 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
HDAC8Q9BY41 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
HDAC8Q9BY41 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
HDAC8Q9BY41 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
HDAC8Q9BY41 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
HDAC8Q9BY41 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
HDAC8Q9BY41 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
HDAC8Q9BY41 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
HDAC8Q9BY41 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
HDAC8Q9BY41 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
HDAC8Q9BY41 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
HDAC8Q9BY41 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
HDAC8Q9BY41 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
HDAC8Q9BY41 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
HDAC8Q9BY41 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
HDAC8Q9BY41 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
HDAC8Q9BY41 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
HDAC8Q9BY41 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
HDAC8Q9BY41 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
HDAC8Q9BY41 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
HDAC8Q9BY41 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
HDAC8Q9BY41 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
HDAC8Q9BY41 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
HDAC8Q9BY41 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
HDAC8Q9BY41 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
HDAC8Q9BY41 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
HDAC8Q9BY41 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
HDAC8Q9BY41 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC21.92■■□□□ 1.1
HDAC8Q9BY41 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms