Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXY4

RSPO3, R-spondin-3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RSPO3Q9BXY4 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
RSPO3Q9BXY4 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
RSPO3Q9BXY4 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
RSPO3Q9BXY4 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
RSPO3Q9BXY4 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
RSPO3Q9BXY4 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
RSPO3Q9BXY4 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
RSPO3Q9BXY4 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
RSPO3Q9BXY4 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
RSPO3Q9BXY4 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
RSPO3Q9BXY4 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
RSPO3Q9BXY4 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
RSPO3Q9BXY4 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
RSPO3Q9BXY4 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
RSPO3Q9BXY4 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
RSPO3Q9BXY4 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
RSPO3Q9BXY4 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
RSPO3Q9BXY4 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
RSPO3Q9BXY4 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
RSPO3Q9BXY4 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
RSPO3Q9BXY4 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
RSPO3Q9BXY4 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
RSPO3Q9BXY4 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
RSPO3Q9BXY4 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
RSPO3Q9BXY4 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC20.29■□□□□ 0.84
RSPO3Q9BXY4 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
RSPO3Q9BXY4 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
RSPO3Q9BXY4 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
RSPO3Q9BXY4 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
RSPO3Q9BXY4 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
RSPO3Q9BXY4 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
RSPO3Q9BXY4 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
RSPO3Q9BXY4 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
RSPO3Q9BXY4 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
RSPO3Q9BXY4 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
RSPO3Q9BXY4 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
RSPO3Q9BXY4 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
RSPO3Q9BXY4 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
RSPO3Q9BXY4 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
RSPO3Q9BXY4 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
RSPO3Q9BXY4 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
RSPO3Q9BXY4 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
RSPO3Q9BXY4 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
RSPO3Q9BXY4 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
RSPO3Q9BXY4 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
RSPO3Q9BXY4 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
RSPO3Q9BXY4 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC20.27■□□□□ 0.84
RSPO3Q9BXY4 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
RSPO3Q9BXY4 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
RSPO3Q9BXY4 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
RSPO3Q9BXY4 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
RSPO3Q9BXY4 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
RSPO3Q9BXY4 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
RSPO3Q9BXY4 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.83
RSPO3Q9BXY4 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
RSPO3Q9BXY4 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
RSPO3Q9BXY4 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
RSPO3Q9BXY4 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
RSPO3Q9BXY4 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC20.26■□□□□ 0.83
RSPO3Q9BXY4 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
RSPO3Q9BXY4 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
RSPO3Q9BXY4 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
RSPO3Q9BXY4 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
RSPO3Q9BXY4 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
RSPO3Q9BXY4 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
RSPO3Q9BXY4 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
RSPO3Q9BXY4 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
RSPO3Q9BXY4 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
RSPO3Q9BXY4 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
RSPO3Q9BXY4 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
RSPO3Q9BXY4 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
RSPO3Q9BXY4 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
RSPO3Q9BXY4 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
RSPO3Q9BXY4 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
RSPO3Q9BXY4 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
RSPO3Q9BXY4 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
RSPO3Q9BXY4 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
RSPO3Q9BXY4 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
RSPO3Q9BXY4 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
RSPO3Q9BXY4 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
RSPO3Q9BXY4 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
RSPO3Q9BXY4 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
RSPO3Q9BXY4 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
RSPO3Q9BXY4 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
RSPO3Q9BXY4 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
RSPO3Q9BXY4 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
RSPO3Q9BXY4 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
RSPO3Q9BXY4 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
RSPO3Q9BXY4 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
RSPO3Q9BXY4 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
RSPO3Q9BXY4 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
RSPO3Q9BXY4 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
RSPO3Q9BXY4 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
RSPO3Q9BXY4 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
RSPO3Q9BXY4 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
RSPO3Q9BXY4 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
RSPO3Q9BXY4 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
RSPO3Q9BXY4 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
RSPO3Q9BXY4 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
RSPO3Q9BXY4 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms