Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXT8

RNF17, RING finger protein 17, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,623 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF17Q9BXT8 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC32.67■■■□□ 2.82
RNF17Q9BXT8 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC32.67■■■□□ 2.82
RNF17Q9BXT8 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
RNF17Q9BXT8 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
RNF17Q9BXT8 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
RNF17Q9BXT8 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
RNF17Q9BXT8 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
RNF17Q9BXT8 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC32.66■■■□□ 2.82
RNF17Q9BXT8 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC32.66■■■□□ 2.82
RNF17Q9BXT8 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC32.66■■■□□ 2.82
RNF17Q9BXT8 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
RNF17Q9BXT8 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC32.66■■■□□ 2.82
RNF17Q9BXT8 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC32.66■■■□□ 2.82
RNF17Q9BXT8 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC32.65■■■□□ 2.82
RNF17Q9BXT8 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
RNF17Q9BXT8 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.65■■■□□ 2.82
RNF17Q9BXT8 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
RNF17Q9BXT8 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC32.65■■■□□ 2.82
RNF17Q9BXT8 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
RNF17Q9BXT8 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
RNF17Q9BXT8 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
RNF17Q9BXT8 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
RNF17Q9BXT8 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC32.64■■■□□ 2.82
RNF17Q9BXT8 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
RNF17Q9BXT8 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC32.64■■■□□ 2.82
RNF17Q9BXT8 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.63■■■□□ 2.81
RNF17Q9BXT8 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC32.63■■■□□ 2.81
RNF17Q9BXT8 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
RNF17Q9BXT8 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
RNF17Q9BXT8 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
RNF17Q9BXT8 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC32.63■■■□□ 2.81
RNF17Q9BXT8 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
RNF17Q9BXT8 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.63■■■□□ 2.81
RNF17Q9BXT8 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
RNF17Q9BXT8 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
RNF17Q9BXT8 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC32.62■■■□□ 2.81
RNF17Q9BXT8 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC32.62■■■□□ 2.81
RNF17Q9BXT8 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
RNF17Q9BXT8 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
RNF17Q9BXT8 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
RNF17Q9BXT8 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC32.62■■■□□ 2.81
RNF17Q9BXT8 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC32.62■■■□□ 2.81
RNF17Q9BXT8 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.61■■■□□ 2.81
RNF17Q9BXT8 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC32.61■■■□□ 2.81
RNF17Q9BXT8 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC32.61■■■□□ 2.81
RNF17Q9BXT8 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC32.61■■■□□ 2.81
RNF17Q9BXT8 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
RNF17Q9BXT8 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC32.61■■■□□ 2.81
RNF17Q9BXT8 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
RNF17Q9BXT8 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
RNF17Q9BXT8 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC32.6■■■□□ 2.81
RNF17Q9BXT8 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC32.6■■■□□ 2.81
RNF17Q9BXT8 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
RNF17Q9BXT8 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.6■■■□□ 2.81
RNF17Q9BXT8 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
RNF17Q9BXT8 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
RNF17Q9BXT8 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.6■■■□□ 2.81
RNF17Q9BXT8 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
RNF17Q9BXT8 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.59■■■□□ 2.81
RNF17Q9BXT8 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC32.59■■■□□ 2.81
RNF17Q9BXT8 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC32.59■■■□□ 2.81
RNF17Q9BXT8 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC32.59■■■□□ 2.81
RNF17Q9BXT8 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC32.59■■■□□ 2.81
RNF17Q9BXT8 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
RNF17Q9BXT8 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
RNF17Q9BXT8 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.59■■■□□ 2.81
RNF17Q9BXT8 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC32.59■■■□□ 2.81
RNF17Q9BXT8 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC32.59■■■□□ 2.81
RNF17Q9BXT8 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
RNF17Q9BXT8 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
RNF17Q9BXT8 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
RNF17Q9BXT8 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
RNF17Q9BXT8 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC32.59■■■□□ 2.81
RNF17Q9BXT8 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC32.59■■■□□ 2.81
RNF17Q9BXT8 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC32.59■■■□□ 2.81
RNF17Q9BXT8 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.58■■■□□ 2.81
RNF17Q9BXT8 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
RNF17Q9BXT8 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
RNF17Q9BXT8 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
RNF17Q9BXT8 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC32.58■■■□□ 2.81
RNF17Q9BXT8 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
RNF17Q9BXT8 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.81
RNF17Q9BXT8 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC32.57■■■□□ 2.81
RNF17Q9BXT8 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
RNF17Q9BXT8 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
RNF17Q9BXT8 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC32.57■■■□□ 2.8
RNF17Q9BXT8 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC32.57■■■□□ 2.8
RNF17Q9BXT8 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC32.57■■■□□ 2.8
RNF17Q9BXT8 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
RNF17Q9BXT8 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
RNF17Q9BXT8 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
RNF17Q9BXT8 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
RNF17Q9BXT8 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC32.56■■■□□ 2.8
RNF17Q9BXT8 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC32.56■■■□□ 2.8
RNF17Q9BXT8 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC32.56■■■□□ 2.8
RNF17Q9BXT8 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC32.56■■■□□ 2.8
RNF17Q9BXT8 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
RNF17Q9BXT8 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC32.55■■■□□ 2.8
RNF17Q9BXT8 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
RNF17Q9BXT8 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC32.55■■■□□ 2.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.6 ms