Protein–RNA interactions for Protein: Q9BWX5

GATA5, Transcription factor GATA-5, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 397 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GATA5Q9BWX5 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
GATA5Q9BWX5 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
GATA5Q9BWX5 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
GATA5Q9BWX5 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
GATA5Q9BWX5 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
GATA5Q9BWX5 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
GATA5Q9BWX5 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
GATA5Q9BWX5 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
GATA5Q9BWX5 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GATA5Q9BWX5 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
GATA5Q9BWX5 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GATA5Q9BWX5 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
GATA5Q9BWX5 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GATA5Q9BWX5 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GATA5Q9BWX5 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
GATA5Q9BWX5 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
GATA5Q9BWX5 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
GATA5Q9BWX5 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GATA5Q9BWX5 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GATA5Q9BWX5 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GATA5Q9BWX5 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
GATA5Q9BWX5 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
GATA5Q9BWX5 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
GATA5Q9BWX5 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
GATA5Q9BWX5 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
GATA5Q9BWX5 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
GATA5Q9BWX5 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
GATA5Q9BWX5 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
GATA5Q9BWX5 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
GATA5Q9BWX5 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC21.54■■□□□ 1.04
GATA5Q9BWX5 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
GATA5Q9BWX5 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
GATA5Q9BWX5 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
GATA5Q9BWX5 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
GATA5Q9BWX5 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
GATA5Q9BWX5 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
GATA5Q9BWX5 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
GATA5Q9BWX5 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
GATA5Q9BWX5 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
GATA5Q9BWX5 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
GATA5Q9BWX5 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
GATA5Q9BWX5 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
GATA5Q9BWX5 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
GATA5Q9BWX5 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
GATA5Q9BWX5 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
GATA5Q9BWX5 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
GATA5Q9BWX5 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
GATA5Q9BWX5 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
GATA5Q9BWX5 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
GATA5Q9BWX5 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
GATA5Q9BWX5 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
GATA5Q9BWX5 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
GATA5Q9BWX5 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
GATA5Q9BWX5 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
GATA5Q9BWX5 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
GATA5Q9BWX5 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
GATA5Q9BWX5 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
GATA5Q9BWX5 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
GATA5Q9BWX5 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
GATA5Q9BWX5 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
GATA5Q9BWX5 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
GATA5Q9BWX5 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
GATA5Q9BWX5 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
GATA5Q9BWX5 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
GATA5Q9BWX5 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
GATA5Q9BWX5 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
GATA5Q9BWX5 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
GATA5Q9BWX5 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
GATA5Q9BWX5 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
GATA5Q9BWX5 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
GATA5Q9BWX5 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
GATA5Q9BWX5 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
GATA5Q9BWX5 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
GATA5Q9BWX5 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
GATA5Q9BWX5 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
GATA5Q9BWX5 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
GATA5Q9BWX5 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
GATA5Q9BWX5 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
GATA5Q9BWX5 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
GATA5Q9BWX5 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
GATA5Q9BWX5 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
GATA5Q9BWX5 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC21.5■■□□□ 1.03
GATA5Q9BWX5 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
GATA5Q9BWX5 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
GATA5Q9BWX5 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
GATA5Q9BWX5 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
GATA5Q9BWX5 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
GATA5Q9BWX5 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
GATA5Q9BWX5 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
GATA5Q9BWX5 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
GATA5Q9BWX5 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
GATA5Q9BWX5 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
GATA5Q9BWX5 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
GATA5Q9BWX5 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
GATA5Q9BWX5 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC21.49■■□□□ 1.03
GATA5Q9BWX5 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
GATA5Q9BWX5 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
GATA5Q9BWX5 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
GATA5Q9BWX5 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
GATA5Q9BWX5 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.7 ms